现代生物信息学及其主要研究领域

第26卷第6期

2000年12月

湖南农业大学学报(自然科学版)

JournalofHunanAgriculturalUniversity(NaturalSciences)

　Vol.26No.6

Dec.2000

　　文章编号:100721032(2000)0620405206

现代生物信息学及其主要研究领域

萧　浪　涛

(湖南农业大学理学院,湖南长沙　410128)

摘　要:信息论方法研究生命科学中各种生物信息的表述、采集、储存、、信息科学、计算机科学、数学、统计学、物理学、.介绍了近年来国内外.关　键　词:;::BioinformaticsandItsMainResearchAreas

XIAOLang2tao

(CollegeofSciences,HNAU,Changsha　410128,PRC)

Abstract:Bioinformatics,asciencedevelopedbytheinteractionofmodernbiology,mathematics,

informatics,computerscience,statistics,physicsandchemistry,studiesthecollection,storage,transfer,search,analysisandtranslationofvariousbiologicalinformation.Thispaperreviewsthedomesticandinternationaldefinitionsaboutbioinformaticsandbrieflyintroducesitsmainre2.searchareasanditsrecentaccomplishments

Keywords:bioinformatics;genome;proteome;database

　　近20年来,生命科学尤其是分子生物学的发展

日新月异.特别是近年来人类基因组计划[1]和水稻基因组计划[2]等大型国际合作研究项目的实施,使人类在生命科学领域尤其是核酸和蛋白质等生物大分子的序列、结构与功能等方面迅速积累了大量数据和信息.与此同时,以计算机技术和网络技术为代表的信息科学也在近20年得到了迅猛的发展.生命科学和信息科学作为世纪之交的两大领头学科,已经相互渗透并与其他学科交叉而派生出很多新的研究领域.其中,由生命科学和信息科学等学科相结合特别是由分子生物学与计算机信息处理技术紧密结合而形成的交叉学科——生物信息学(Bioinformat2ics)

[3～6]

被誉为“解读生命天书的慧眼”.在今后相当长的时

期内,特别是在完成基因组测序以后的“后基因组时代”,生物信息学将在解读基因组序列中的功能信息等方面发挥更大的作用.

1　生物信息学的定义

1.1　目前对生物信息学的几种定义

应运而生,并大大推动了相关研究的开展,

　　由于生物信息学是一门新兴的、正在迅速发展的交叉学科,目前国内外对生物信息学的定义众说纷纭,没有形成统一的、普遍公认的认识.以下是一些较有影响的定义.

美国国家基因组研究中心认为,生物信息学是一个代表生物学、数学和计算机的综合力量的新兴学科(Bioinformaticsisanemergingscientificdisci2plinerepresentingthecombinedpowerofbiology,

[7]

mathematics,andcomputers).

　　收稿日期:2000209206

　　基金项目:教育部留学生基金资助项目

　　作者简介:萧浪涛(19632),男(汉族),湖南桃江人,博士,湖南农业大学教授.

美国乔治亚理工大学认为,生物信息学是采用数学、统计学和计算机等方法分析生物学、生物化学

406

湖南农业大学学报(自然科学版)2000年12

月　

和生物物理学数据的一种综合(Bioinformaticsisanintegrationofmathematical,statisticalandcom2putermethodstoanalyzebiological,biochemical

[8]

andbiophysicaldata).

美国密苏里大学认为,生物信息学是获知、管理和处理生物学信息的科学与技术(Bioinformaticsisthescienceandtechnologyaboutlearning,manag2

[9]

ingandprocessingbiologicalinformation).

息学丰富多彩的相关学科和研究领域及其由信息流方向主导的研究过程,不难归纳出如下较为合理的定义:现代生物信息学是采用计算机技术和信息论方法研究蛋白质及核酸序列等各种生物信息的采集、储存、传递、检索、分析和解读的科学,是现代生命科学与信息科学、计算机科学、、统计学、物理.

美国加利福尼亚大学洛杉矶分校认为,生物信究.istheofbiological.informationbsystems

Itbringsto2

gethertheavalancheofsystematicbiologicaldatawiththeanalytictheoryandpracticaltoolsof[10]

mathematicsandcomputerscience).

Whatis.com网站认为,生物信息学是以加快生

2　　基因组学(Genomics)和蛋白组学(Proteomics)

的实质就是分析和解读核酸和蛋白质序列中所表达的结构与功能的生物信息.这方面的研究已成为生物信息学的主要研究内容之一.2.1.1　基因组学

物学研究为目的而建立计算机数据库和运算方法的科学(Bioinformaticsisthescienceofdevelopingcomputerdatabasesandalgorithmsforthepurposeof

speeding

[11]

research).

up

and

enhancing

biological

一种生物的全部遗传构成被称为该种生物的基因组.有关基因组的研究称为基因组学.其中,序列基因组学(Sequencegenomics)主要研究测序和核苷酸序列[14];结构基因组学(Structuralgenomics)着重于遗传图谱、物理图谱和测序等方面的研究;功能基因组学(Functionalgenomics)则研究以转录图为基础的基因组表达图谱[14,15];比较基因组学(Comparativege2nomics)的研究内容包括对不同进化阶段基因组的比较和不同种群和群体基因组的比较[16].

1985年,美国能源部(DOE)基于研究核辐射对人类核酸伤害的需要,首次提出对约含30亿碱基对的人类基因组全部碱基序列进行测序.美国1990年启动了预期15年、投资30亿美元的人类基因组计划.由于很多国家的参与,现已发展成人类科学史上规模空前的国际人类基因组计划(HGP)[1].中国参加了这一计划并承担了其中1%的测序任务.2000年5月11日,该计划宣布完成了人类基因组草图,全部测序将提前于2001年6月完成.自1995年完成第一个全基因组序列(流感嗜血杆菌,Haemophilusinfluenzae)以来,随着人类基因组计划、水稻OryzasativaL.基因组计划[2]、拟南芥

[17]

Arabidopsisthaliana　和果蝇Drosophilamelan2

[18]

ogaster　等模式动植物基因组计划以及各种微生物基因组计划的成功实施,全基因组的研究已成为基因组学的重要内容.目前包括大肠杆菌Escher2

ichiacoli　和酵母菌Saccharomycescerevisiae　

[19]

[20]

中国军事医学科学院欧阳曙光等认为,生物信息学是研究生物信息的采集、处理、存储、传布、分析和解释的科学,它通过综合数学、计算机科学与工程和生物学的工具与技术揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘[12].

中国北京生物技术和新医药产业中心认为,生物信息学是在生命科学研究中以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学[13].以上对生物信息学的种种不同定义都从不同的角度反映了生物信息学这一新学科的主要特点或其主要研究内容.

1.2　现代生物信息学的定义

　　在中国,传统意义上的生物信息学是指研究生物发光、生物电、生物磁和激素等信息物质的传递现象及其相应测定技术的科学,属于生物物理学的范畴.事实上,现代生物信息学已在广度和深度上得以大大扩展,例如与众多学科形成的各种交叉研究领域以及在分子生物学领域的极度深入.国内曾一度出现过“细胞信息学”、“细胞通讯学”、和“信息生物学”等关于生物信息学的多种别称.纵观现代生物信

在内的数十个全基因组的测序已经完成并另有数十

　第26卷第6期萧浪涛　现代生物信息学及其主要研究领域407

个全基因组序列即将完成.2.1.2　蛋白组学

2.2　生物芯片研究

蛋白组和蛋白组学的概念是随基因组和基因组学的出现而出现的.蛋白组(proteme)的概念是由于基因表达水平并不能代表细胞中活性蛋白质的数量,基因组序列并不能描述活性蛋白质所必需的翻译后修饰和反映蛋白质种类和含量的动态变化过程而提出的.在一定条件下某一基因组蛋白质表达的数量类型称为蛋白组,代表这一有机体全部蛋白质组成及其作用方式.学.其中,[烯酰胺凝胶电泳分离复杂的蛋白质组分,并利用专用软件采集和分析凝胶电泳图谱资料,结合氨基酸组成分析和质谱分析对蛋白质斑点进行精确鉴定,以获得蛋白质组成、表达差异和修饰情况等方面的大量信息.蛋白组学研究首先在一些基因组研究已经完成的原核生物和简单真核生物等方面取得了丰富的研究成果.例如,已从流感嗜血杆菌的蛋白组中鉴定出300余种蛋白质[23],从果蝇的蛋白组电泳图谱中分离了2000多个蛋白斑点[24].2.1.3　基因组和蛋白组研究中的生物信息学

[22]

　　生物芯片是近年由分子生物学发展而来的一种

新技术,是一个学科高度交叉、产业化前景极为广阔的研究领域,具有巨大的理论意义和实用价值.生物芯片通常指通过微加工技术和微电子技术在固体芯片表面构建的微型生物化学分析系统,能够高速率、高通量地完成对细胞、以及其他生物集成化、微型.40万个DNA,100万.现已能在约1cm2的生物芯片上,用分子探针检测数万至数十万碱基对区域中的任何区段[27].2.2.1　生物芯片的类型及其用途

生物芯片主要包括基因芯片(DNA芯片,gene

蛋白芯片(pro2chip,DNAchip,DNAmicroarray)、

[28]

teinchip)和芯片实验室(lab2on2a2chip)等.其中,基因芯片是生物芯片中研究最早、最先商品化的产品.它利用核酸双链的互补碱基之间的氢键作用,形成稳定的双链结构,通过检测目的单链上的荧光信号而实现样品的检测[29].基因芯片可广泛应用于

[30]

基因突变检测[31]、疾病诊断[32]、新基DNA测序、

因的寻找、基因转录分析、基因表达检测、药物筛选

、农作物育种、环保检测、食品卫生监督和司法鉴定等用途[33～35].生物芯片将改变生命科学的研究方式,是继大规模集成电路之后的又一次具有深远意义的技术革命.此外,近来发现一些半醌类化合物和某些蛋白质分子具有类似于晶体管的开关状态,推断由此可能设计出生物“计算芯片”和“生物计算

[36]机”.事实上,这类研究还刚刚起步,与一些媒体的夸大宣传相去甚远.

2.2.2　生物信息学在生物芯片研究中的应用

基因组和蛋白组研究是生物信息学的主要内容.同样,生物信息学是基因组和蛋白组研究中必不可少的工具.最近,有人进一步提出了“基因组信息学”和“蛋白组信息学”的概念[3],作为生物信息学在基因组和蛋白组研究领域的分支.生物信息学在基因组和蛋白组研究中所起的作用主要有:

(1)基因组信息结构的计算分析.即对基因组数据进行大规模并行计算并预测各种新基因和功能位点,研究大量非编码区序列的信息结构和可能的生物学意义[25].

(2)模式生物全基因组信息结构的比较研究.即对已完成全基因组测序的各种模式生物的基因组信息结构进行比较分析,包括同源序列的搜索比较和指导基因克隆[26].

(3)功能基因组的相关信息分析,包括对基因表达图谱及其相关算法和软件的研究,与功能基因组信息相关的核酸、蛋白质的空间结构的预测模拟以及蛋白质的功能预测[25].

生物芯片技术主要包括芯片方阵的构建、样品

的制备、生物反应和信号检测及分析等环节.信号检测是将芯片置入专用扫描仪中,通过采集各反应点的荧光位置、荧光强弱,再经相关软件分析图像,以快速准确地获取样品中的生物信息.因此,生物芯片技术中整个检测及分析技术环节都属于生物信息学的研究领域.

2.3　生物信息数据库

　　极其复杂的生物和生物界本身和日新月异的生命科学研究产生出大量的生物学信息.对这些信息的储存、检索、比较分析必须借助于计算机数据库技

408

湖南农业大学学报(自然科学版)2000年12月　

41]

术[37],包括各类生物学信息数据库的建立与维护、数据的添加与注释、更新与查询、数据库资料的网络化等研究内容[38].生物信息数据库已成为生物信息学的主要研究领域之一,其研究表现出以下的特点:

(1)种类不断增加(表1).除较早的核酸序列数据库[39]外,近年来大量出现了基因组数据库、基因

图谱数据库[40,、蛋白质序列和蛋白质结构数据

库[42]、酶类数据库、细胞系数据库[41]、免疫学数据

库、生物反应数据库等[43].此外,还有生物学文献数据库、生物学软件数据库[44]以及一体化的综合生物信息学数据库等类型[45],几乎涉及了生物学研究中的所有研究领域.

表1Table1　SomeimportantbiologicalinformasonI数据库名　

GenbankEBITIGKGDBHuGeMapTIAKAtDBRiceGenesSoyBaseZmDBCropNetFlybaseWormBaseNEXTIDBSGDECDCGenProtECNRsubDDBJMitbaseGSDBEMBLPIRYPD

SWISS2PROTPDBSCOPOWLCLDBUM2BBDBIOSISBioinform国　际　互　联　网　址　(U

第26卷第6期

2000年12月

湖南农业大学学报(自然科学版)

JournalofHunanAgriculturalUniversity(NaturalSciences)

　Vol.26No.6

Dec.2000

　　文章编号:100721032(2000)0620405206

现代生物信息学及其主要研究领域

萧　浪　涛

(湖南农业大学理学院,湖南长沙　410128)

摘　要:信息论方法研究生命科学中各种生物信息的表述、采集、储存、、信息科学、计算机科学、数学、统计学、物理学、.介绍了近年来国内外.关　键　词:;::BioinformaticsandItsMainResearchAreas

XIAOLang2tao

(CollegeofSciences,HNAU,Changsha　410128,PRC)

Abstract:Bioinformatics,asciencedevelopedbytheinteractionofmodernbiology,mathematics,

informatics,computerscience,statistics,physicsandchemistry,studiesthecollection,storage,transfer,search,analysisandtranslationofvariousbiologicalinformation.Thispaperreviewsthedomesticandinternationaldefinitionsaboutbioinformaticsandbrieflyintroducesitsmainre2.searchareasanditsrecentaccomplishments

Keywords:bioinformatics;genome;proteome;database

　　近20年来,生命科学尤其是分子生物学的发展

日新月异.特别是近年来人类基因组计划[1]和水稻基因组计划[2]等大型国际合作研究项目的实施,使人类在生命科学领域尤其是核酸和蛋白质等生物大分子的序列、结构与功能等方面迅速积累了大量数据和信息.与此同时,以计算机技术和网络技术为代表的信息科学也在近20年得到了迅猛的发展.生命科学和信息科学作为世纪之交的两大领头学科,已经相互渗透并与其他学科交叉而派生出很多新的研究领域.其中,由生命科学和信息科学等学科相结合特别是由分子生物学与计算机信息处理技术紧密结合而形成的交叉学科——生物信息学(Bioinformat2ics)

[3～6]

被誉为“解读生命天书的慧眼”.在今后相当长的时

期内,特别是在完成基因组测序以后的“后基因组时代”,生物信息学将在解读基因组序列中的功能信息等方面发挥更大的作用.

1　生物信息学的定义

1.1　目前对生物信息学的几种定义

应运而生,并大大推动了相关研究的开展,

　　由于生物信息学是一门新兴的、正在迅速发展的交叉学科,目前国内外对生物信息学的定义众说纷纭,没有形成统一的、普遍公认的认识.以下是一些较有影响的定义.

美国国家基因组研究中心认为,生物信息学是一个代表生物学、数学和计算机的综合力量的新兴学科(Bioinformaticsisanemergingscientificdisci2plinerepresentingthecombinedpowerofbiology,

[7]

mathematics,andcomputers).

　　收稿日期:2000209206

　　基金项目:教育部留学生基金资助项目

　　作者简介:萧浪涛(19632),男(汉族),湖南桃江人,博士,湖南农业大学教授.

美国乔治亚理工大学认为,生物信息学是采用数学、统计学和计算机等方法分析生物学、生物化学

406

湖南农业大学学报(自然科学版)2000年12

月　

和生物物理学数据的一种综合(Bioinformaticsisanintegrationofmathematical,statisticalandcom2putermethodstoanalyzebiological,biochemical

[8]

andbiophysicaldata).

美国密苏里大学认为,生物信息学是获知、管理和处理生物学信息的科学与技术(Bioinformaticsisthescienceandtechnologyaboutlearning,manag2

[9]

ingandprocessingbiologicalinformation).

息学丰富多彩的相关学科和研究领域及其由信息流方向主导的研究过程,不难归纳出如下较为合理的定义:现代生物信息学是采用计算机技术和信息论方法研究蛋白质及核酸序列等各种生物信息的采集、储存、传递、检索、分析和解读的科学,是现代生命科学与信息科学、计算机科学、、统计学、物理.

美国加利福尼亚大学洛杉矶分校认为,生物信究.istheofbiological.informationbsystems

Itbringsto2

gethertheavalancheofsystematicbiologicaldatawiththeanalytictheoryandpracticaltoolsof[10]

mathematicsandcomputerscience).

Whatis.com网站认为,生物信息学是以加快生

2　　基因组学(Genomics)和蛋白组学(Proteomics)

的实质就是分析和解读核酸和蛋白质序列中所表达的结构与功能的生物信息.这方面的研究已成为生物信息学的主要研究内容之一.2.1.1　基因组学

物学研究为目的而建立计算机数据库和运算方法的科学(Bioinformaticsisthescienceofdevelopingcomputerdatabasesandalgorithmsforthepurposeof

speeding

[11]

research).

up

and

enhancing

biological

一种生物的全部遗传构成被称为该种生物的基因组.有关基因组的研究称为基因组学.其中,序列基因组学(Sequencegenomics)主要研究测序和核苷酸序列[14];结构基因组学(Structuralgenomics)着重于遗传图谱、物理图谱和测序等方面的研究;功能基因组学(Functionalgenomics)则研究以转录图为基础的基因组表达图谱[14,15];比较基因组学(Comparativege2nomics)的研究内容包括对不同进化阶段基因组的比较和不同种群和群体基因组的比较[16].

1985年,美国能源部(DOE)基于研究核辐射对人类核酸伤害的需要,首次提出对约含30亿碱基对的人类基因组全部碱基序列进行测序.美国1990年启动了预期15年、投资30亿美元的人类基因组计划.由于很多国家的参与,现已发展成人类科学史上规模空前的国际人类基因组计划(HGP)[1].中国参加了这一计划并承担了其中1%的测序任务.2000年5月11日,该计划宣布完成了人类基因组草图,全部测序将提前于2001年6月完成.自1995年完成第一个全基因组序列(流感嗜血杆菌,Haemophilusinfluenzae)以来,随着人类基因组计划、水稻OryzasativaL.基因组计划[2]、拟南芥

[17]

Arabidopsisthaliana　和果蝇Drosophilamelan2

[18]

ogaster　等模式动植物基因组计划以及各种微生物基因组计划的成功实施,全基因组的研究已成为基因组学的重要内容.目前包括大肠杆菌Escher2

ichiacoli　和酵母菌Saccharomycescerevisiae　

[19]

[20]

中国军事医学科学院欧阳曙光等认为,生物信息学是研究生物信息的采集、处理、存储、传布、分析和解释的科学,它通过综合数学、计算机科学与工程和生物学的工具与技术揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘[12].

中国北京生物技术和新医药产业中心认为,生物信息学是在生命科学研究中以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学[13].以上对生物信息学的种种不同定义都从不同的角度反映了生物信息学这一新学科的主要特点或其主要研究内容.

1.2　现代生物信息学的定义

　　在中国,传统意义上的生物信息学是指研究生物发光、生物电、生物磁和激素等信息物质的传递现象及其相应测定技术的科学,属于生物物理学的范畴.事实上,现代生物信息学已在广度和深度上得以大大扩展,例如与众多学科形成的各种交叉研究领域以及在分子生物学领域的极度深入.国内曾一度出现过“细胞信息学”、“细胞通讯学”、和“信息生物学”等关于生物信息学的多种别称.纵观现代生物信

在内的数十个全基因组的测序已经完成并另有数十

　第26卷第6期萧浪涛　现代生物信息学及其主要研究领域407

个全基因组序列即将完成.2.1.2　蛋白组学

2.2　生物芯片研究

蛋白组和蛋白组学的概念是随基因组和基因组学的出现而出现的.蛋白组(proteme)的概念是由于基因表达水平并不能代表细胞中活性蛋白质的数量,基因组序列并不能描述活性蛋白质所必需的翻译后修饰和反映蛋白质种类和含量的动态变化过程而提出的.在一定条件下某一基因组蛋白质表达的数量类型称为蛋白组,代表这一有机体全部蛋白质组成及其作用方式.学.其中,[烯酰胺凝胶电泳分离复杂的蛋白质组分,并利用专用软件采集和分析凝胶电泳图谱资料,结合氨基酸组成分析和质谱分析对蛋白质斑点进行精确鉴定,以获得蛋白质组成、表达差异和修饰情况等方面的大量信息.蛋白组学研究首先在一些基因组研究已经完成的原核生物和简单真核生物等方面取得了丰富的研究成果.例如,已从流感嗜血杆菌的蛋白组中鉴定出300余种蛋白质[23],从果蝇的蛋白组电泳图谱中分离了2000多个蛋白斑点[24].2.1.3　基因组和蛋白组研究中的生物信息学

[22]

　　生物芯片是近年由分子生物学发展而来的一种

新技术,是一个学科高度交叉、产业化前景极为广阔的研究领域,具有巨大的理论意义和实用价值.生物芯片通常指通过微加工技术和微电子技术在固体芯片表面构建的微型生物化学分析系统,能够高速率、高通量地完成对细胞、以及其他生物集成化、微型.40万个DNA,100万.现已能在约1cm2的生物芯片上,用分子探针检测数万至数十万碱基对区域中的任何区段[27].2.2.1　生物芯片的类型及其用途

生物芯片主要包括基因芯片(DNA芯片,gene

蛋白芯片(pro2chip,DNAchip,DNAmicroarray)、

[28]

teinchip)和芯片实验室(lab2on2a2chip)等.其中,基因芯片是生物芯片中研究最早、最先商品化的产品.它利用核酸双链的互补碱基之间的氢键作用,形成稳定的双链结构,通过检测目的单链上的荧光信号而实现样品的检测[29].基因芯片可广泛应用于

[30]

基因突变检测[31]、疾病诊断[32]、新基DNA测序、

因的寻找、基因转录分析、基因表达检测、药物筛选

、农作物育种、环保检测、食品卫生监督和司法鉴定等用途[33～35].生物芯片将改变生命科学的研究方式,是继大规模集成电路之后的又一次具有深远意义的技术革命.此外,近来发现一些半醌类化合物和某些蛋白质分子具有类似于晶体管的开关状态,推断由此可能设计出生物“计算芯片”和“生物计算

[36]机”.事实上,这类研究还刚刚起步,与一些媒体的夸大宣传相去甚远.

2.2.2　生物信息学在生物芯片研究中的应用

基因组和蛋白组研究是生物信息学的主要内容.同样,生物信息学是基因组和蛋白组研究中必不可少的工具.最近,有人进一步提出了“基因组信息学”和“蛋白组信息学”的概念[3],作为生物信息学在基因组和蛋白组研究领域的分支.生物信息学在基因组和蛋白组研究中所起的作用主要有:

(1)基因组信息结构的计算分析.即对基因组数据进行大规模并行计算并预测各种新基因和功能位点,研究大量非编码区序列的信息结构和可能的生物学意义[25].

(2)模式生物全基因组信息结构的比较研究.即对已完成全基因组测序的各种模式生物的基因组信息结构进行比较分析,包括同源序列的搜索比较和指导基因克隆[26].

(3)功能基因组的相关信息分析,包括对基因表达图谱及其相关算法和软件的研究,与功能基因组信息相关的核酸、蛋白质的空间结构的预测模拟以及蛋白质的功能预测[25].

生物芯片技术主要包括芯片方阵的构建、样品

的制备、生物反应和信号检测及分析等环节.信号检测是将芯片置入专用扫描仪中,通过采集各反应点的荧光位置、荧光强弱,再经相关软件分析图像,以快速准确地获取样品中的生物信息.因此,生物芯片技术中整个检测及分析技术环节都属于生物信息学的研究领域.

2.3　生物信息数据库

　　极其复杂的生物和生物界本身和日新月异的生命科学研究产生出大量的生物学信息.对这些信息的储存、检索、比较分析必须借助于计算机数据库技

408

湖南农业大学学报(自然科学版)2000年12月　

41]

术[37],包括各类生物学信息数据库的建立与维护、数据的添加与注释、更新与查询、数据库资料的网络化等研究内容[38].生物信息数据库已成为生物信息学的主要研究领域之一,其研究表现出以下的特点:

(1)种类不断增加(表1).除较早的核酸序列数据库[39]外,近年来大量出现了基因组数据库、基因

图谱数据库[40,、蛋白质序列和蛋白质结构数据

库[42]、酶类数据库、细胞系数据库[41]、免疫学数据

库、生物反应数据库等[43].此外,还有生物学文献数据库、生物学软件数据库[44]以及一体化的综合生物信息学数据库等类型[45],几乎涉及了生物学研究中的所有研究领域.

表1Table1　SomeimportantbiologicalinformasonI数据库名　

GenbankEBITIGKGDBHuGeMapTIAKAtDBRiceGenesSoyBaseZmDBCropNetFlybaseWormBaseNEXTIDBSGDECDCGenProtECNRsubDDBJMitbaseGSDBEMBLPIRYPD

SWISS2PROTPDBSCOPOWLCLDBUM2BBDBIOSISBioinform国　际　互　联　网　址　(U