高效纤维素降解菌的筛选及复合菌系的构建

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高效纤维素降解菌的筛选及复合菌系的构建

王海滨“2韩立荣“2冯俊涛“2张兴“2’

l陕西省生物农药工程技术研究中心,杨凌7121002西北农林科技大学植保资源与病虫害治理研究中心,杨凌712100+通讯作者,z11)【ingl952@126.com

摘要本研究旨在筛选高效纤维素降解菌,组建复合菌系,用于堆肥接种剂的开发。通过纤维素刚果

红选择性培养基,从腐殖土、堆肥样品中分离高效纤维素降解常温菌和耐高温菌。经过羧甲基纤维素酶

活(carboxymethyl

cellulase,CMCase)、滤纸条崩解能力、对稻杆及苦参(Jsop危om触∥∞ce琊Ait.)残渣在液态

和固态发酵条件下的降解能力测定逐级淘汰,筛选高效菌株组建复合菌系。研究结果表明,通过拮抗作

用、单一菌株在复合菌系中作用测定,最终构建了由3株细菌(弗留明拜叶林克氏菌(眈i如rinc七施

∥umi加瑚括)、微杆菌(肘记r06nc把一“msp.)和芽胞杆菌∞nc垅凇sp.)),l株链霉菌(Jsf阳lp£om弦∞sp.)和1株毛壳

菌(佩oefomiMmsp.)组成的木质纤维素降解高效复合菌系。供试菌株在液态发酵条件下对稻杆和苦参残

渣的降解效果明显强于固态发酵,稻杆比苦参残渣更容易被大多数微生物降解,供试真菌在稻杆和苦参

残渣的降解中普遍表现出较高的降解效果。筛选得到弗留明拜叶林克氏菌xM一3可以在48h内将滤纸条完全崩解,复合菌系在固态发酵20d后对苦参残渣和稻秆的降解率分别达到31.4%和63.1%。本研究

对堆肥接种剂的开发具有参考和借鉴意义。

关键词筛选,纤维素降解菌,滤纸崩解,复合菌系,苦参残渣

Screening

ofHighly

EfjEicient

Cellulose

DegradationMicrobes

and

Cons饥lction

WANG

andPest

ofCompositeStrains

HANLi—Ron91’2

FENGJun—Tho∽

ZHANGXing¨+

Hai—Binl2

1Biopesticide1'echnology&EngineeringCenterShaanxiPmvince,Yangling712lOO,China;2KeyLaboratoryofP1antProtectionResources

ManagementMinistryofEducation,NonhwestA&FUniversi吼Yangling7l2l00,China

+Con℃sponding

author'2dⅨin91952@126.com

atscreening

Abstract

Amlingmesophilic

andhightemperatureresistantmicrobesofhighly

emcient

cellulose—degradationandconstnJctingcomposites仃ains

for印plication

as

compostinoculant,themicrobes

humussoil

wereisolatedusingcelluloseCongoredselectiVemediumunderroomandandcompostsamples.Detectionsofcarboxymethyldegradationabilit)rofricestrawand

hi曲temperatures仔om

cellulase(CMCase)activi吼filterp印er

underliquid

degradationandandsolidstate

radix(Jsop^oroe∥o秽∞ce琊Ait.)residues

fermentationconditionsofisolatedmicrobeswereperfonned,andhighlyemcientmicrobeswhichwereused

to

constmctthecompositestrainswereselected.Thennallyconstnlctedlignocellulosedegradationcomposite

strainsofhighe街ciency,which

wasdetemlinedbyantagonismandsin91es仃aincontributionamongthe

compositestrainsanalysis,contained3bacteria(Be咖而zc后施∥Mmine淞括,n以cr060c把riMm

on

sp.andBoc垅w

sp.),

1Js£rep幻,叼,cessp.andlC矗oe£omiumsp..Resultsshowedthatthedegradationen、ectsresidues

were

strongerby

thetestedmicmbes

under

ricestrawandradix

thesolidstate

liquid

state

fementation

thanin

基金项目:国家高技术研究发展计划(863)项目(No.20llAAlOA202一1)收稿日期:2014.12—02接受日期:2015一01—04

422

农业生物技术学报

JounlalofAgricultumlBiotechnology

fenllentation.Thericestrawwasmorelikelytobedegradedbymostofthetestedstrainsthantheradixresidues,andthe如ngispeciesshowedgreaterresiduesdegradation.The

efI色cts锄ong

thetestedmicrc}besinthericestI.awandradix

degradedthefilter

Be咖riw后施∥umi聊珊厶s缸.ainxM一3

p印erstripecompletely

within48h.Thecompositestrainsdegraded31.4%and63.1%oftheradixresiduesandricestrawaRer20dofsolidstateKeywordsfb衄entation.This

studyprovidesref.erenceforthedevelopmentofcompostinoculants.

Screening,Cellulosedegmdationmicrobes,Filterp印erdegradation,Composite

strains,Radix

1.esjdl】es

中国的植物提取物产业如中药提取、植物源农药提取及食品加工等每年产生大量有机固体废弃物,仅

中药提取一项每年产残渣就达150万t左右(Wang

et

a1.,2010)。此类废弃物一般采取焚烧、填埋等手段处理,既污染了环境又造成大量资源的浪费。堆肥是一

种处理大量有机固体废弃物的有效手段。植物提取

残渣中往往木质纤维素含量较高,而此类物质在堆肥过程中降解缓慢,腐熟周期长,成为制约其堆肥化处理的一大瓶颈。通过在堆肥过程中接种高效木质纤维素降解菌可以有效促进木质纤维素的降解,缩短堆肥发酵周期,加速堆肥腐熟,提高堆肥品质(王伟东等,2008;刘佳等,2011)。因而,筛选具有木质纤维素酶活力的高效菌株,构建高效堆肥接种剂,成为堆肥化处理植物提取所产生大量有机固态残渣的有效手段(Zengeta1.,2010)。

单一菌株作为堆肥接种剂作用有限,构建由不同特性的多菌株组成的复合菌系用于促进木质纤维素的降解或堆肥发酵,受到越来越多的重视(牛俊玲等,2007)。复合菌系构建往往通过直接筛选或对已有高效菌株组合来实现。大多数研究采用直接筛选法,通过连续多代驯化培养得到复合菌系(Guo

eta1.,2008;2010;Harutaet

a1.,2002;崔宗均

等,2002),而利用不同高效菌株组合来构建复合菌系的研究较少。通过直接筛选法构建复合菌系,往往存在复合菌系中菌株组成种类多,鉴定困难,群落结构容易受到营养及环境条件影响等(崔诗法等,2009)。通过对已有高效菌株进行组合,各菌株的特性明确,单一菌株活性高,质量和稳定性容易控制。本研究从腐殖土、堆肥样品中分离筛选高效木质纤维素降解菌株,然后通过合理优化组合构建高效复合菌系,为同类研究和堆肥接种剂的开发提供参考。

1材料与方法

1.1实验材料1.1.1样品来源

从渭南、杨凌、天水等地采集的腐殖土、堆肥样品用于常温菌的分离筛选。从牛粪和秸秆堆肥的高温期采样用于耐高温菌的分离筛选。

苦参残渣为豆科苦参属植物苦参(sop^or0.肛一秽船ce瑚A∽根部经乙醇提取后的剩余物,本研究所

用苦参残渣来自山西德威生化有限公司。

1.1.2培养基

纤维素刚果红培养基:CMC—Na2

g/L,呷。)2S04

2g/L,NaCl0.5g/L,K2HPO。1g/L,MgS0—7H:O0.5

g/L,刚果红0.4g/L,琼脂12g/L,pH7.0。

滤纸条崩解培养基:(NH一)zSO。1.0g/L,Mg-

SO。‘7H:O0.5g/L,KH:PO。1.O

g/L,酵母膏0.1

g/L,

滤纸条(1cm×6

cm)3条/三角瓶,pH

7.0。

羧甲基纤维素钠培养基:CMC—Na

10

g/L,蛋

白胨2

g/L,NaCl0.5,KzHPo。1

g/L,MgS0。。7H:O

0.5

g/L,酵母膏0.5g/L,琼脂12∥L,pH

7.0。

稻杆及苦参残渣降解培养基:营养液A包括蛋白胨2g/L,MgSO。‘7HzO

O.5g/L,KHzPO。1.0g/L,

NaCl0.5

g/L,酵母膏0.5g/L,CaClz0.2

g/L,pH

7.0;

营养液B成分同营养液A,浓度为营养液A的5倍。1.2实验方法

1.2.1常温菌的筛选和纯化

将采集的样品用无菌水逐级10倍稀释至10~、10‘5和10巧倍后,分别取0.1mL涂布于纤维素刚果红选择性培养基上,每个浓度涂5个平板,28℃下培养,定期观察,挑取菌落周围出现清晰透明圈的菌株,通过划线法分离纯化。分别用马铃薯葡萄糖琼脂培养基(PDA),牛肉膏蛋白胨及高氏一号培养基培养真菌,细菌和放线菌,并用斜面低温保藏法保存(下同)。

1.2.2耐高温菌的筛选和纯化

取样品5g加入100mL蒸馏水,于65℃水浴

72

h,然后稀释至lO~、10。3和104倍后,分别吸取0.1mL涂布于纤维素刚果红选择性培养基上,45℃培养,定期观察,挑取菌落周围出现清晰透明圈的菌株,通过划线法分离,纯化。

1.2.3

羧甲基纤维素酶(CMCase)活性测定

将纯化后的菌株分别涂布于不同的营养琼脂

培养基平板(细菌用牛肉膏蛋白胨培养基、放线菌用高氏一号培养基、真菌用PDA培养基),待菌落长出后,用打孔器打6mm的菌饼接种于纤维素刚果红平板,28℃培养3d后(耐高温菌45℃培养),测量透明圈直径大小。1.2.4滤纸条崩解实验

滤纸条崩解实验可以反映不同菌株所分泌的各种纤维酶的综合酶活力水平。用无菌水将所获得的具有高CMCase活性的菌株斜面培养物分别制成菌悬液,分别接种2mL于装有100mL滤纸条崩解培养基的250mL三角瓶中,摇床培养(28℃,

130

r/min),定期观察滤纸条崩解情况。耐高温菌

在45℃,130r/min条件下培养(下同)。

1.2.5液态发酵降解稻杆及苦参残渣

将稻杆和苦参残渣粉碎,过60目筛,50℃烘至恒重。在每个三角瓶中加入100mL营养液A,然后分别加入2g稻杆或苦参残渣,12l℃灭菌20

min,

各接种2mL菌悬液,28℃,130r/min培养,耐高温菌在45℃下培养。10d后,将培养物5000×g离心

10

min,弃上清,用盐酸和硝酸的混合液冲洗消除

菌体,5000×g离心10min,用蒸馏水洗,5000×g离心10min,105℃烘至恒重,计算失重率。对照不接种菌悬液(下同)。

1.2.6固态发酵降解稻杆及苦参残渣

在每个三角瓶中加入15mL营养液B,再分别加入10g稻杆或苦参残渣,121℃灭菌20min,各接种2mL菌悬液,28℃静置培养,每隔3d用手摇匀一次。10d后培养物各加入100mL蒸馏水,5

000№

离心10min,弃上清,用盐酸和硝酸混合液冲洗消除菌体,5000獬离心10min,用蒸馏水洗,5000橹离心10min,105℃烘至恒重,计算失重率。

1.2.7拮抗实验

分别取各菌悬液0.5mL,用涂布器均匀涂于直径为150mm的羧甲基纤维素钠培养基上。将灭菌滤纸片(1cm×1cm)在各菌悬液中完全浸湿,然后

将滤纸片均匀分布,平铺于涂布了单一菌悬液的羧甲基纤维素钠培养基平板上。28℃培养3d后分别检查各菌株(滤纸片)和涂布于羧甲基纤维素钠培养基上单一菌株之间的拮抗活性。

1.2.8复合菌系中不同菌株组合粗酶液制备及滤纸酶活性(Fpase)测定

设置xM一3等单一菌实验组、6株菌组合即Totol实验组、除去1株菌之后任意5株菌的组合(例如除去xM一3的组合为T01一xM一3实验组)等。将各菌株组合的菌悬液按照体积比1:1混合,分别接种2mL于苦参残渣降解培养基中f成分同1.2.6),28℃下静置培养,每隔3d用手摇匀,保证物料均匀及氧气充足。每个处理设置3个重复。培养10d后,每个三角瓶中加入50mL无菌水,室温下120r/min摇床培养2

h,8

000×g离心10min,上

清作为粗酶液采用DNS法(李合生,2000)用于滤纸酶活测定,酶活力单位(u),即每分钟产生1斗mol葡萄糖的酶量为1

U。

1.2.9复合菌系中不同菌株组合对苦参残渣降解能力测定

发酵方式同1.2.8,待发酵至第20d时,在各个三角瓶中加入100mL无菌水,室温120r/min摇床h,5

000×g离心10min,弃上清,加入盐酸和

水洗,5000獬离心10min,105℃烘至恒重,计算失重率。对照采用相同处理但不接种菌悬液。每个处理设置3个重复。1.2.10菌株鉴定

细菌、放线菌采用形态、生理生化及16S

rRNA

内转录间隔区(inemal仃ansc抽edspacer,ITS)区序

列比对进行鉴定。细菌和放线菌总DNA采用细菌

京),真菌总DNA采用真菌基因组提取试剂盒提取

菌总DNA为模板,

1492R:5’CGGCTACCTTGTTACGAC3’。

rRNA序列。PCR反应体Bu行.er

5¨L,MgCl:3

uL,dNTP4“L,

pL,

DNA聚合酶(5U/斗L)0.5此,加ddH:O至50

培养2

硝酸的混合液冲洗消除菌体,离心,弃上清,用蒸馏

序列比对进行鉴定;真菌采用形态及核糖体DNA

基因组提取试剂盒提取(CW0552,康为世纪,北

(D3390—01,0mega,广州)。以提取的细菌和放线8F:5’GAGAGTTTGATCCTGGCTCAG3’:作引物扩增菌株的16S系:10×PCR

模板1“L,引物8F和1492R(10¨mol/L)各1

r死q

424篙譬主盏a。…酬。科

uL。PCR反应条件:95cC变性5

min,94

cC变性1菌(5株放线菌,16株细菌,2株真菌)和216株常温菌。常温菌中54株培养72h的透明圈直径超过

10

min,54℃退火1min,72℃延伸2min,30个循环;72℃延伸7min。以提取的真菌总DNA为模板,通用引物:

ITSl5.8SF:5’TCCGTAGGTGAACCTGC3’:ITS45.8SR:5’TCCTCCGCTTATTGATATGC3’。

mm,进行后续实验。

2.2滤纸条崩解实验

对筛选得到的54株常温菌和23株耐高温茵进一步测定了其各自的滤纸条崩解能力。测定结果表明,绝大多数菌株对滤纸条均有一定的崩解能力。25d内有26株菌可以将滤纸条完全崩解(表1),其中包含17株细菌、5株放线菌和4株真菌。常温细菌xM.3降解能力最强,可以在48h之内将滤纸条完全崩解(图2)。耐高温菌中,G一13可以在

扩增菌株的ITS序列。PCR反应体系:10×PCR

Bu虢r5斗L,MgClz

酶(5

pL,dNTP4肛L,模板1pL,引

物ITSl和ITS4(10斗mol/L)各lpL,r死gDNA聚合

U/¨L)0.25皿,加ddHz0至50肛L。PCR反应

条件:94cC预变性5min,94℃变性1min,53℃退火1min,72℃延伸50s,30个循环;72℃延伸10min。用凝胶提取回收试剂盒纯化回收PCR产物,送上海英骏生物技术公司测序。将所测16S

rRNA

d内将滤纸条完全崩解。

和ITS区序列与GenBank中己知的相关的序列进行多重比对,用ClustalX和Mega4.O软件包进行序

2.3供试菌株对稻杆和苦参残渣降解实验

对2.2中26株菌进一步测定了其对稻杆及苦参残渣的降解能力。

2.3.1

列比对和系统发育分析,并用Nei曲bor-joining算

法构建系统发育树。1.3数据处理

采用SPSS18.O软件对数据进行单因素方差分析及显著性检验。

液态发酵条件下,供试菌株对稻杆及苦参

残渣的降解效果

各菌株对稻秆和苦参残渣均表现出一定的降

解作用(图3A)。其中,木霉菌(嘶c危D如rmosp.)LA一

9对稻秆和苦参残渣的降解率最高(P<O.05),分别为32.8%和19.6%。细菌XM.3对稻秆和苦参残渣的降解率分别为24.8%和13.6%。放线菌LS.12和

2结果与分析

2.1纤维素刚果红培养基筛选菌株

分离纯化得到239株菌可以在纤维素刚果红培养基上形成清晰透明圈(图1),包含23株耐高温

TS.7对稻秆的降解率分别为21.7%和20.7%,对苦参残渣的降解率分别为8.1%和12.3%。绝大多数菌株在液态发酵条件下对稻秆的降解作用显著大

图2菌株的滤纸条崩解效果

Fnterpaperdegradationeffectofstrains

FiguI.e2

XM.3培养第2天(A)和xM一8培养第3天(C),左边为对照;Ts.3(B)和NF.2培养第9天(D),右边为对照。与对照相比,滤纸条完全崩解

xM一32dcultivated(A)andxM.83dcultivated(C),respec—

tively,theleRwascon仃ol;TS一3(B)andNF一2(D)9dcultivat.edfor,respectively,therightwascon仃01.Comparedwithn-ol,filterpaperstripesweredegradedcompletely

con—

于其对苦参残渣的降解(P<0.051。

2.3.2

XM一3、XM一8、WS一3、WS一4和TS一3在对两者的降解中也表现出了较高的活力。和液态发酵下相似,绝大多数菌株在固态发酵条件下对稻秆的降解作用

固态发酵条件下,供试菌株对稻秆及苦参残

渣的降解效果

固态发酵条件下对稻秆降解作用最强的菌株

为放线菌LS一12(图3B),降解率达到了19.O%(P<0.05)。其次,放线菌TS一7和真菌LA一9对稻秆的降解率分别为17.9%和18.3%。在供试菌株中,对苦参残渣降解作用最强的为真菌LA一9,降解率为10.3%(P<0.05)。放线菌中的LS一12和TS一7对稻秆及苦参残渣均表现出较强的降解作用,细菌中的

表1

26株菌的滤纸条崩解实验

要高于其对苦参残渣的降解。

2.4复合菌系构建

根据CMCase酶活力,滤纸条崩解能力及各菌株对稻杆和苦参残渣的降解效果,结合在堆肥过程中常温菌、耐高温菌及细菌、放线菌和真菌之间的协同作用,最终选取xM一3等12株菌作为构建复合菌系的初选菌株。其中包含了细菌、放线菌和真

Tablel

Resultsof6lterpaperstripesdegradatjonby26strains

+:滤纸软化;++:1/4降解;+++:1/2降解;++++:3/4降解;+++++:完全降解;1~3:耐高温菌:4~26:常温菌:下同

+:Fiterp印ersoRened;十+:1/4degraded;+++:l/2degraded;++++:3/4degraded;+++++:A11degraded;l~3:Hightempemtureresistantmicmo唱anisms;4~26:Mesophilicmicroo唱anisms;Thesamebelow

426淼臻当盖慧。。眦。h山纠

菌,同时也包含了常温菌和耐高温菌。这12株菌著的滤纸条崩解能力(表1);TS一3、WS.3和WS.4三之间的拮抗作用结果见表2。从表2可以看出,菌者除具有较高的滤纸条崩解能力及对稻杆和苦参株XM.3和XM.8存在拮抗作用,同时G一2、G一3和残渣的降解能力外(表l,图3和4),还具有较强的LS一12均对XM一8产生拮抗作用。菌株WS.3与G一琼胶酶活力(结果未列出);G一2、G一3和G—13均可以2、G.3、G.13及LA.9存在拮抗作用。3株耐高温菌耐受65℃的高温,G一13表现出相对较高的降解能中只有G—13与其他菌株存在较少的拮抗作用。菌力(表l,图3);放线菌TS一7和LS一12表现出较高残株TS一7和其他菌株具有较好的相容性。真菌中的渣降解活力和一定的表面活性(图3)。综上所述,LA.9与多株菌(WS一3,G一2,G一3和G一13)存在拮抗选取XM一3、TS.3、G一13、LS.12、TS一7和SLT_12这6作用。在12株初选菌株中:XM一3和XM.8具有显

株菌组建复合菌系。

习稻杆

Ricestraw

j苫参残渣Radix

residues

a旱

∞1

蔷.董z

蓁量2

234567891011121314151617l819202l2223242526

菌株Strains

图3

26株菌对稻杆及苦参残渣在液态(A)和固态(B)发酵条件下的降解效果

F蟾ure3

Degradati伽rate

ofricestrawand

mdix

residuesby26

strai璐underUquid(A)andsoIid(B)state

fe珊entation

根据邓肯多重范围检验,不同字母表示处理间存在显著差异(P<O.05),菌株编号及相关信息见表l,下同

AccordingtoDuncan’smutiplemngetest,difrerentlettersindicatesignificantdifference(P<0.05)among

treatments,StrainNo

andtheirinformations

see

T曲le

1.thesamebelow

表212株木质纤维素降解茵之间的拮抗活性

TabIe2

Theantagonisticactivitiesamong12strainswithlignocelIuIose

degmdingabiIity

菌株

XM一3XM-8TS.3

WS.4wS一3

G一2G一3

G.13

LS.12

TS.7

LA一9

SLl二12

Strains

++十

什+

一+

抖抖

抖+

抖抖

抖抖

什o名,4抖

+什抖

一一

+什

一++

++

抖一一

H+

一¨

++

Ⅲ煳;垒啪∞叭峪;查№邮3他7母u

~:具有拮抗作用;+:菌株间无明显拮抗作用但不能交叉生长;++:菌株间无拮抗作用,可以交叉生长

~:AntagonismbeMeenMo

strains;+:Nosigllmcantantagonismbet、veen

Mo

s仃ains,but

no

cmssgro、^,th;++:Nosignificant

an—

tagonism

be帆eenMo

strains,and

cmss伊。叭h

2.5单一菌株在复合菌系中的作用测定

为了用最少的菌株构建对木质纤维素降解能力尽可能强的复合菌系,通过测定不同菌株组合的滤纸酶活力和对苦参残渣的降解,进一步测定了复合菌系中单一菌株在复合菌系中发挥作用的大小。

2.5.1

系滤纸酶活力的影响较小。

2.5.2不同菌株组合对苦参残渣的降解

由图4B可知,不同菌株处理对苦参残渣的降解效果存在较大差异。不同菌株组合对苦参残渣

的降解效果均未显著低于任何单一菌株(P>O.05),

说明单一菌株所分泌酶的种类和数量有限,不及复合菌系,苦参残渣的降解需要多种酶的协同作用。

不同菌株组合的滤纸酶活力

由图4A可以看出,除Tot—LS.12外,各复合菌

系的滤纸酶活力均显著高于单一菌株(P<0.05),说

明通过构建复合菌系的方法可以显著提高菌系的滤纸酶活力水平。在单一菌株中,3株细菌(xM一3,TS一3和G一13)的滤纸酶活力要显著低于放线菌(LS一12)和真菌(SLT-12)(P<0.05),其中以真菌SLT-12的酶活力最高。复合菌系中Tot—TS一7的酶活力最高,表明放线菌TS一7在菌株群体的生长增殖过程中,可能与其他菌株存在营养或空间的竞争,从而对其他菌株产生了一定的抑制作用,导致复合菌系整体酶活力的降低。而T0t—LS—12和Tot—SLT-12与Total相比,酶活力显著降低(P<0.05),说明放线菌LS.12和真菌sLT-12在复合菌系中发挥很重要的作用,能提高整个菌系的酶活力。Tot—xM一3、Tot—TS一3和T0t—G一13三者与Totol之间的酶活力差异不显著(P>0.05),说明3株细菌的存在与否对复合菌

单一菌株处理中,真菌SLT.12对苦参残渣的降解

率显著高于其他菌株(P<0.05),而细菌TS一3对苦参残渣的降解率最低(P<0.05),说明在对天然木质纤维素材料的降解过程中真菌往往发挥重要作用。与Totol相比,Tot—LS.12、Tot—SL卫12、Tot—XM一3和Tot—TS.3的降解率均显著降低(尸<0.05),说明复合菌系中LS—12、SLT-12、xM一3和TS一3在对苦参残渣的降解中均发挥了重要作用,特别是LS一12和SLT-12。Tot—G.13与Totol对苦参残渣的降解率差异不显著(P>0.05),说明耐高温细菌G一13在复合菌系中发挥的作用较小,可能与其在常温下与其他菌株相比,竞争力不足相关;同时也说明该菌株对复合菌系中其他菌株作用的发挥没有负面影响,在堆肥的高温阶段,该菌株将发挥作用。与Totol相比,T0t—TS一7对苦参残渣的降解率显著升高(P<0.051,达到31.4%,这说明放线菌TS.7对复合菌系

一宣3

¥蜒避螺煺

12345678910ll1213

组别Groups

图4不同菌株处理发酵液的滤纸酶活力(A)和对苦参残渣的降解(B)

FigIlre4

Fp鹪eactiviti鼯(A)anddegradation

rate

ofmdixr鹪idu髂(B)ofthedi仃erentstrai璐treatedcult町e

medi岫

1:xM.3:2:TS.3;3:G.13;4:Ts.7;5:LS一12;6:sLT.12;7:除xM一3之外的其他5株菌(Tot.xM.3);8:除TS一3之外的其他5株菌(Tot.TS.3);9:除G.13之外的其他5株菌(Tot—G一13);10:除TS.7之外的其他5株菌(Tot—TS-7);11:除LS-12之外的其他5株菌(Tot.LS一12);12:除Su二12之外的其他5株菌(Tot.Su二12);13:1~6株菌的组合(Tot01);下同

l:XM.3:2:TS.3:3:G.13;4:TS一7;5:LS.12;6:S【jr-12;7:Theomer5stainswimoutxM-3(Tbt-XM一3);8:Theother5stains

withoutTS.3fTot—TS.3);9:Theother5stainswithoutG-13(Tot-G一13);10:Theother5stainswithoutother5stainswimoutLS.12(Tot—LS.12);12:Theother5stainswithout

TS一7(Tot—TS一7);11:T11e

combinationof

1~6

SL,T-12(Tot—SLT二12);13:Strain

(Tbt01);The

s锄e

below

428盏兰警譬淼。。龇。㈦咧

中其他菌株产生了一定的抑制作用,限制了其他菌

(日P咖一聊七沉∥Ⅱmi舶m厶,KP398562),Ts-3为微杆菌属(心cr060c把riMmsp.,Ⅺ139435),G一13为芽胞杆菌

对苦参残渣的有效降解。

综上表明,复合菌系中去掉放线菌TS一7就可以有效提高整个复合菌系的滤纸酶活力和对苦参残渣的降解能力。本研究最终确定将xM一3、TS一3、G一13、LS—12和SLT-12作为构建复合菌系的最终菌株。

将上述5株菌按照体积比1:l混合接种于固体稻秆降解培养基,发酵20d后测得稻秆的失重率为

63.1%。

属∞oc谢凇sp.,Ⅺ139434),LS—12为链霉菌属(S£即一

£o哗es

sp.,IUl39431)(图5),SLT-12为毛壳菌属

(吼。e£omiumsp.,KM098053)(图6)。

3讨论

木质纤维素降解菌的筛选中,应根据筛选目的

和筛选所处阶段灵活采用多重评价标准。不同微生物特性不同,表现出来的酶活力与其对底物的降

2.6菌株鉴定结果

根据形态学,生理生化及16SrRNA或ITS区序列比对结果表明,xM一3为弗留明拜叶林克氏菌

解能力间的相关性存在差异,微生物对真实底物的降解往往最能反映其实际应用潜力。本研究中,供试菌株在液态酵条件下对稻秆的降解效果普遍高

图5

xM-3、TS.3、G.13和LS.12的16SrRNA基因序列系统发育树

Phyloge耻tictr∞0fXM-3,TS-3,G-13and

LS-1216S

FigIlre5

rI斟Agenesequenc鹤

于对苦参残渣的降解(P<0.05),这与苦参残渣中木质素含量高且含有某些抑菌化学成分相关(杨雪云

理优化组合来构建复合菌系可以达到高效降解木质纤维素的目的。研究表明,单一的细菌、真菌和放线菌尽管活性较高,但在加速堆肥化进程中的效果却不如复合微生物菌群的共同作用,自然界中木质素纤维素的降解是真菌、细菌及相应微生物群落

等,2008),同时也说明微生物对不同底物的降解能力和适应性存在差异。研究显示,细菌和真菌降解

木质纤维素的机理不同,真菌主要靠分泌多种胞外酶对木质纤维素进行降解;而大多数细菌对木质纤维素的降解是通过细胞表面酶进行的,需要附着在木质纤维素表面上才能将其降解(李振红,陆贻通,2003)。本研究中,在复合菌系中分别除去细菌XM.3、TS一3和G一13前后的滤纸酶活力相比差异不显著(P>0.05),这可能与大多细菌本身胞外酶活力低相关(Rabinovich

et

共同作用的结果(蒋荣清等,2010)。崔宗均等

(2002)利用酸碱互补的原则驯化得到高效复合菌系MCl,该复合菌系在72h对滤纸的降解率为94.0%。邱向阳等(2003)在秸秆堆肥中以纤维素为唯一碳源筛选得到一批具有较高纤维素降解能力的微生物,通过正交实验得到4组复合菌剂可以在

a1.,2002;赵彩云等,2009)。

d内快速启动滤纸条降解。王伟东等(2005)利用

发酵液的酶活只能反映胞外酶活力大小,而非微生物对木质纤维素的降解能力。滤纸聚合度和结晶度中等,接近天然纤维素,滤纸酶活反映了纤维素酶的总糖化能力(傅力等,2000),因而在纤维素降解菌的筛选中被广泛采用,同时也便于不同研究之间效果的比较。然而,微生物对天然木质纤维素材料的降解会更直接反映其降解能力及实际应用潜力。本研究中供试的4株真菌(LA一4,LA.9,Lx一1和SLT-12,图3)在液态发酵条件下对稻秆和苦参残渣均表现出较高的降解效果(P<0.05),而细菌和放线菌中仅有少数菌株对两者的降解效果相对较高,这说明真菌在木质纤维素的降解中通常发挥重要作用。此外,本研究采用CMCase酶活、滤纸条

限制性培养技术经过多代驯化及优化得到高效复合菌系WSC.6,该复合菌系在72h内对滤纸的降解率为97.0%,对稻杆的降解率为28.2%。崔诗法等(2009)从枯枝落叶中分离到一组纤维素分解复合菌系St一13,该复合菌系由平板可分离细菌和难培养细菌组成,该复合菌系5d可使滤纸完全崩溃;本研究构建的复合菌系中菌株xM一3,可以在

48

h内将滤纸条完全崩解,效果强于上述己报道菌

株及菌株组合:经鉴定,菌株xM一3经鉴定为弗留

明拜叶林克氏菌,为一种固氮菌,这也是首次报道该菌具有较强的纤维素酶活和滤纸条崩解能力,后续可以开展该菌在降解纤维素过程中的固氮作用研究。刘甲锋等(2010)采用限制性培养技术与温度梯度诱导相结合的方法从土壤中筛选、构建出一组在中温条件下对水稻秸秆具有腐解功能的复合菌系RSS一4,该复合菌系腐解16d对稻秆、纤维素及半纤维素的降解率分别达到了45.0%、55.5%和44.1%。Yang等(2004)构建了一组由里氏木霉

崩解、对苦参和稻秆在液体和固态发酵下的降解等多重标准评价各菌株的活力,同时通过在复合菌系

中剔除某株菌来研究该菌株在复合菌系中的作用及其对其他菌株的影响,为木质纤维素降解菌的筛选及复合菌系的构建提供了一条有效途径。

将不同特性的高效木质纤维素降解菌通过合

(nic^o如r,礼口rees反)、黑曲霉(A5卵卿ZZ榔n橱er)和酒

图6真菌SLT.12的ITS区基因序列系统发育树

FigIlre6

Phyloge眦tic

tr∞of劬giSLT-12b嬲ed

on

ITSgenesequen∞s

430惫鉴警譬盖煞。眦。酬。科

精酵母(&cc^口rDm”esceM厶i口∞)组成的复合菌系,该复合菌系的最高滤纸酶活力为5.64U/g,对稻壳

的降解率为28.05%。林捷等(2006)用6株相互间无拮抗作用的纤维素分解菌进行混合发酵,大幅度提高了纤维素酶活力及对还原糖的耐受力。本研究中,通过构建复合菌系混合发酵培养,显著提高了其滤纸酶活力和对苦参残渣及稻秆的降解效果(P<0.05)。最终得到的复合菌系对苦参残渣和稻秆固态发酵20d的降解率分别达到31.4%和63.1%。苦参提取残渣和中药提取残渣一样,代表了一大类工业生产有机固体废弃物,此类废弃物木质纤维素含量高,堆肥化处理困难,关于此类物质处理的报道极少,本研究通过将不同菌株组合构建复合菌系显著提高了微生物对此类物质的降解,为堆肥化处理此类物质、开发堆肥接种剂提供了一条有效途径。同时,本研究所构建的复合菌系只有5株菌组成,生产工序简单,质量容易控制,在实际生产应用中操作性强。

4结论

本研究通过纤维素刚果红选择性培养基初筛得到大量纤维素降解菌,然后经过滤纸条崩解实验,对苦参残渣和稻杆在液态和固态发酵条件下的降解实验,层层筛选,最后通过拮抗和组合实验,最终构建了由弗留明拜叶林克氏菌、微杆菌属、芽胞杆菌属、链霉菌属和毛壳菌属5株菌组成的复合菌系。该复合菌系单一菌株活性高,对稻杆和苦参残渣具有较强的降解能力,且效果不比通过直接筛选法得到的复合菌系效果差;同时该复合菌系菌株组成简单、各菌株特性明确、在实际应用中质量容易

控制、实用性强,为堆肥接种剂的开发提供了一条

新的途径。

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(责任编辑

马丽萍)

高效纤维素降解菌的筛选及复合菌系的构建

作者:

作者单位:刊名:英文刊名:年,卷(期):

王海滨, 韩立荣, 冯俊涛, 张兴, WANG Hai-Bin, HAN Li-Rong, FENG Jun-Tao, ZHANG Xing陕西省生物农药工程技术研究中心,杨凌712100;西北农林科技大学植保资源与病虫害治理研究中心,杨凌712100

农业生物技术学报

Journal of Agricultural Biotechnology2015,23(4)

引用本文格式:王海滨.韩立荣.冯俊涛.张兴.WANG Hai-Bin.HAN Li-Rong.FENG Jun-Tao.ZHANG Xing 高效纤维素降解菌的筛选及复合菌系的构建[期刊论文]-农业生物技术学报 2015(4)

,蚕蟊k疆

/0n|InesVstem:httD:/^^n^n^f.iabiotech.orq

采叠生■拄艉’I蠢

枷…冀装赫赫‰gy

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高效纤维素降解菌的筛选及复合菌系的构建

王海滨“2韩立荣“2冯俊涛“2张兴“2’

l陕西省生物农药工程技术研究中心,杨凌7121002西北农林科技大学植保资源与病虫害治理研究中心,杨凌712100+通讯作者,z11)【ingl952@126.com

摘要本研究旨在筛选高效纤维素降解菌,组建复合菌系,用于堆肥接种剂的开发。通过纤维素刚果

红选择性培养基,从腐殖土、堆肥样品中分离高效纤维素降解常温菌和耐高温菌。经过羧甲基纤维素酶

活(carboxymethyl

cellulase,CMCase)、滤纸条崩解能力、对稻杆及苦参(Jsop危om触∥∞ce琊Ait.)残渣在液态

和固态发酵条件下的降解能力测定逐级淘汰,筛选高效菌株组建复合菌系。研究结果表明,通过拮抗作

用、单一菌株在复合菌系中作用测定,最终构建了由3株细菌(弗留明拜叶林克氏菌(眈i如rinc七施

∥umi加瑚括)、微杆菌(肘记r06nc把一“msp.)和芽胞杆菌∞nc垅凇sp.)),l株链霉菌(Jsf阳lp£om弦∞sp.)和1株毛壳

菌(佩oefomiMmsp.)组成的木质纤维素降解高效复合菌系。供试菌株在液态发酵条件下对稻杆和苦参残

渣的降解效果明显强于固态发酵,稻杆比苦参残渣更容易被大多数微生物降解,供试真菌在稻杆和苦参

残渣的降解中普遍表现出较高的降解效果。筛选得到弗留明拜叶林克氏菌xM一3可以在48h内将滤纸条完全崩解,复合菌系在固态发酵20d后对苦参残渣和稻秆的降解率分别达到31.4%和63.1%。本研究

对堆肥接种剂的开发具有参考和借鉴意义。

关键词筛选,纤维素降解菌,滤纸崩解,复合菌系,苦参残渣

Screening

ofHighly

EfjEicient

Cellulose

DegradationMicrobes

and

Cons饥lction

WANG

andPest

ofCompositeStrains

HANLi—Ron91’2

FENGJun—Tho∽

ZHANGXing¨+

Hai—Binl2

1Biopesticide1'echnology&EngineeringCenterShaanxiPmvince,Yangling712lOO,China;2KeyLaboratoryofP1antProtectionResources

ManagementMinistryofEducation,NonhwestA&FUniversi吼Yangling7l2l00,China

+Con℃sponding

author'2dⅨin91952@126.com

atscreening

Abstract

Amlingmesophilic

andhightemperatureresistantmicrobesofhighly

emcient

cellulose—degradationandconstnJctingcomposites仃ains

for印plication

as

compostinoculant,themicrobes

humussoil

wereisolatedusingcelluloseCongoredselectiVemediumunderroomandandcompostsamples.Detectionsofcarboxymethyldegradationabilit)rofricestrawand

hi曲temperatures仔om

cellulase(CMCase)activi吼filterp印er

underliquid

degradationandandsolidstate

radix(Jsop^oroe∥o秽∞ce琊Ait.)residues

fermentationconditionsofisolatedmicrobeswereperfonned,andhighlyemcientmicrobeswhichwereused

to

constmctthecompositestrainswereselected.Thennallyconstnlctedlignocellulosedegradationcomposite

strainsofhighe街ciency,which

wasdetemlinedbyantagonismandsin91es仃aincontributionamongthe

compositestrainsanalysis,contained3bacteria(Be咖而zc后施∥Mmine淞括,n以cr060c把riMm

on

sp.andBoc垅w

sp.),

1Js£rep幻,叼,cessp.andlC矗oe£omiumsp..Resultsshowedthatthedegradationen、ectsresidues

were

strongerby

thetestedmicmbes

under

ricestrawandradix

thesolidstate

liquid

state

fementation

thanin

基金项目:国家高技术研究发展计划(863)项目(No.20llAAlOA202一1)收稿日期:2014.12—02接受日期:2015一01—04

422

农业生物技术学报

JounlalofAgricultumlBiotechnology

fenllentation.Thericestrawwasmorelikelytobedegradedbymostofthetestedstrainsthantheradixresidues,andthe如ngispeciesshowedgreaterresiduesdegradation.The

efI色cts锄ong

thetestedmicrc}besinthericestI.awandradix

degradedthefilter

Be咖riw后施∥umi聊珊厶s缸.ainxM一3

p印erstripecompletely

within48h.Thecompositestrainsdegraded31.4%and63.1%oftheradixresiduesandricestrawaRer20dofsolidstateKeywordsfb衄entation.This

studyprovidesref.erenceforthedevelopmentofcompostinoculants.

Screening,Cellulosedegmdationmicrobes,Filterp印erdegradation,Composite

strains,Radix

1.esjdl】es

中国的植物提取物产业如中药提取、植物源农药提取及食品加工等每年产生大量有机固体废弃物,仅

中药提取一项每年产残渣就达150万t左右(Wang

et

a1.,2010)。此类废弃物一般采取焚烧、填埋等手段处理,既污染了环境又造成大量资源的浪费。堆肥是一

种处理大量有机固体废弃物的有效手段。植物提取

残渣中往往木质纤维素含量较高,而此类物质在堆肥过程中降解缓慢,腐熟周期长,成为制约其堆肥化处理的一大瓶颈。通过在堆肥过程中接种高效木质纤维素降解菌可以有效促进木质纤维素的降解,缩短堆肥发酵周期,加速堆肥腐熟,提高堆肥品质(王伟东等,2008;刘佳等,2011)。因而,筛选具有木质纤维素酶活力的高效菌株,构建高效堆肥接种剂,成为堆肥化处理植物提取所产生大量有机固态残渣的有效手段(Zengeta1.,2010)。

单一菌株作为堆肥接种剂作用有限,构建由不同特性的多菌株组成的复合菌系用于促进木质纤维素的降解或堆肥发酵,受到越来越多的重视(牛俊玲等,2007)。复合菌系构建往往通过直接筛选或对已有高效菌株组合来实现。大多数研究采用直接筛选法,通过连续多代驯化培养得到复合菌系(Guo

eta1.,2008;2010;Harutaet

a1.,2002;崔宗均

等,2002),而利用不同高效菌株组合来构建复合菌系的研究较少。通过直接筛选法构建复合菌系,往往存在复合菌系中菌株组成种类多,鉴定困难,群落结构容易受到营养及环境条件影响等(崔诗法等,2009)。通过对已有高效菌株进行组合,各菌株的特性明确,单一菌株活性高,质量和稳定性容易控制。本研究从腐殖土、堆肥样品中分离筛选高效木质纤维素降解菌株,然后通过合理优化组合构建高效复合菌系,为同类研究和堆肥接种剂的开发提供参考。

1材料与方法

1.1实验材料1.1.1样品来源

从渭南、杨凌、天水等地采集的腐殖土、堆肥样品用于常温菌的分离筛选。从牛粪和秸秆堆肥的高温期采样用于耐高温菌的分离筛选。

苦参残渣为豆科苦参属植物苦参(sop^or0.肛一秽船ce瑚A∽根部经乙醇提取后的剩余物,本研究所

用苦参残渣来自山西德威生化有限公司。

1.1.2培养基

纤维素刚果红培养基:CMC—Na2

g/L,呷。)2S04

2g/L,NaCl0.5g/L,K2HPO。1g/L,MgS0—7H:O0.5

g/L,刚果红0.4g/L,琼脂12g/L,pH7.0。

滤纸条崩解培养基:(NH一)zSO。1.0g/L,Mg-

SO。‘7H:O0.5g/L,KH:PO。1.O

g/L,酵母膏0.1

g/L,

滤纸条(1cm×6

cm)3条/三角瓶,pH

7.0。

羧甲基纤维素钠培养基:CMC—Na

10

g/L,蛋

白胨2

g/L,NaCl0.5,KzHPo。1

g/L,MgS0。。7H:O

0.5

g/L,酵母膏0.5g/L,琼脂12∥L,pH

7.0。

稻杆及苦参残渣降解培养基:营养液A包括蛋白胨2g/L,MgSO。‘7HzO

O.5g/L,KHzPO。1.0g/L,

NaCl0.5

g/L,酵母膏0.5g/L,CaClz0.2

g/L,pH

7.0;

营养液B成分同营养液A,浓度为营养液A的5倍。1.2实验方法

1.2.1常温菌的筛选和纯化

将采集的样品用无菌水逐级10倍稀释至10~、10‘5和10巧倍后,分别取0.1mL涂布于纤维素刚果红选择性培养基上,每个浓度涂5个平板,28℃下培养,定期观察,挑取菌落周围出现清晰透明圈的菌株,通过划线法分离纯化。分别用马铃薯葡萄糖琼脂培养基(PDA),牛肉膏蛋白胨及高氏一号培养基培养真菌,细菌和放线菌,并用斜面低温保藏法保存(下同)。

1.2.2耐高温菌的筛选和纯化

取样品5g加入100mL蒸馏水,于65℃水浴

72

h,然后稀释至lO~、10。3和104倍后,分别吸取0.1mL涂布于纤维素刚果红选择性培养基上,45℃培养,定期观察,挑取菌落周围出现清晰透明圈的菌株,通过划线法分离,纯化。

1.2.3

羧甲基纤维素酶(CMCase)活性测定

将纯化后的菌株分别涂布于不同的营养琼脂

培养基平板(细菌用牛肉膏蛋白胨培养基、放线菌用高氏一号培养基、真菌用PDA培养基),待菌落长出后,用打孔器打6mm的菌饼接种于纤维素刚果红平板,28℃培养3d后(耐高温菌45℃培养),测量透明圈直径大小。1.2.4滤纸条崩解实验

滤纸条崩解实验可以反映不同菌株所分泌的各种纤维酶的综合酶活力水平。用无菌水将所获得的具有高CMCase活性的菌株斜面培养物分别制成菌悬液,分别接种2mL于装有100mL滤纸条崩解培养基的250mL三角瓶中,摇床培养(28℃,

130

r/min),定期观察滤纸条崩解情况。耐高温菌

在45℃,130r/min条件下培养(下同)。

1.2.5液态发酵降解稻杆及苦参残渣

将稻杆和苦参残渣粉碎,过60目筛,50℃烘至恒重。在每个三角瓶中加入100mL营养液A,然后分别加入2g稻杆或苦参残渣,12l℃灭菌20

min,

各接种2mL菌悬液,28℃,130r/min培养,耐高温菌在45℃下培养。10d后,将培养物5000×g离心

10

min,弃上清,用盐酸和硝酸的混合液冲洗消除

菌体,5000×g离心10min,用蒸馏水洗,5000×g离心10min,105℃烘至恒重,计算失重率。对照不接种菌悬液(下同)。

1.2.6固态发酵降解稻杆及苦参残渣

在每个三角瓶中加入15mL营养液B,再分别加入10g稻杆或苦参残渣,121℃灭菌20min,各接种2mL菌悬液,28℃静置培养,每隔3d用手摇匀一次。10d后培养物各加入100mL蒸馏水,5

000№

离心10min,弃上清,用盐酸和硝酸混合液冲洗消除菌体,5000獬离心10min,用蒸馏水洗,5000橹离心10min,105℃烘至恒重,计算失重率。

1.2.7拮抗实验

分别取各菌悬液0.5mL,用涂布器均匀涂于直径为150mm的羧甲基纤维素钠培养基上。将灭菌滤纸片(1cm×1cm)在各菌悬液中完全浸湿,然后

将滤纸片均匀分布,平铺于涂布了单一菌悬液的羧甲基纤维素钠培养基平板上。28℃培养3d后分别检查各菌株(滤纸片)和涂布于羧甲基纤维素钠培养基上单一菌株之间的拮抗活性。

1.2.8复合菌系中不同菌株组合粗酶液制备及滤纸酶活性(Fpase)测定

设置xM一3等单一菌实验组、6株菌组合即Totol实验组、除去1株菌之后任意5株菌的组合(例如除去xM一3的组合为T01一xM一3实验组)等。将各菌株组合的菌悬液按照体积比1:1混合,分别接种2mL于苦参残渣降解培养基中f成分同1.2.6),28℃下静置培养,每隔3d用手摇匀,保证物料均匀及氧气充足。每个处理设置3个重复。培养10d后,每个三角瓶中加入50mL无菌水,室温下120r/min摇床培养2

h,8

000×g离心10min,上

清作为粗酶液采用DNS法(李合生,2000)用于滤纸酶活测定,酶活力单位(u),即每分钟产生1斗mol葡萄糖的酶量为1

U。

1.2.9复合菌系中不同菌株组合对苦参残渣降解能力测定

发酵方式同1.2.8,待发酵至第20d时,在各个三角瓶中加入100mL无菌水,室温120r/min摇床h,5

000×g离心10min,弃上清,加入盐酸和

水洗,5000獬离心10min,105℃烘至恒重,计算失重率。对照采用相同处理但不接种菌悬液。每个处理设置3个重复。1.2.10菌株鉴定

细菌、放线菌采用形态、生理生化及16S

rRNA

内转录间隔区(inemal仃ansc抽edspacer,ITS)区序

列比对进行鉴定。细菌和放线菌总DNA采用细菌

京),真菌总DNA采用真菌基因组提取试剂盒提取

菌总DNA为模板,

1492R:5’CGGCTACCTTGTTACGAC3’。

rRNA序列。PCR反应体Bu行.er

5¨L,MgCl:3

uL,dNTP4“L,

pL,

DNA聚合酶(5U/斗L)0.5此,加ddH:O至50

培养2

硝酸的混合液冲洗消除菌体,离心,弃上清,用蒸馏

序列比对进行鉴定;真菌采用形态及核糖体DNA

基因组提取试剂盒提取(CW0552,康为世纪,北

(D3390—01,0mega,广州)。以提取的细菌和放线8F:5’GAGAGTTTGATCCTGGCTCAG3’:作引物扩增菌株的16S系:10×PCR

模板1“L,引物8F和1492R(10¨mol/L)各1

r死q

424篙譬主盏a。…酬。科

uL。PCR反应条件:95cC变性5

min,94

cC变性1菌(5株放线菌,16株细菌,2株真菌)和216株常温菌。常温菌中54株培养72h的透明圈直径超过

10

min,54℃退火1min,72℃延伸2min,30个循环;72℃延伸7min。以提取的真菌总DNA为模板,通用引物:

ITSl5.8SF:5’TCCGTAGGTGAACCTGC3’:ITS45.8SR:5’TCCTCCGCTTATTGATATGC3’。

mm,进行后续实验。

2.2滤纸条崩解实验

对筛选得到的54株常温菌和23株耐高温茵进一步测定了其各自的滤纸条崩解能力。测定结果表明,绝大多数菌株对滤纸条均有一定的崩解能力。25d内有26株菌可以将滤纸条完全崩解(表1),其中包含17株细菌、5株放线菌和4株真菌。常温细菌xM.3降解能力最强,可以在48h之内将滤纸条完全崩解(图2)。耐高温菌中,G一13可以在

扩增菌株的ITS序列。PCR反应体系:10×PCR

Bu虢r5斗L,MgClz

酶(5

pL,dNTP4肛L,模板1pL,引

物ITSl和ITS4(10斗mol/L)各lpL,r死gDNA聚合

U/¨L)0.25皿,加ddHz0至50肛L。PCR反应

条件:94cC预变性5min,94℃变性1min,53℃退火1min,72℃延伸50s,30个循环;72℃延伸10min。用凝胶提取回收试剂盒纯化回收PCR产物,送上海英骏生物技术公司测序。将所测16S

rRNA

d内将滤纸条完全崩解。

和ITS区序列与GenBank中己知的相关的序列进行多重比对,用ClustalX和Mega4.O软件包进行序

2.3供试菌株对稻杆和苦参残渣降解实验

对2.2中26株菌进一步测定了其对稻杆及苦参残渣的降解能力。

2.3.1

列比对和系统发育分析,并用Nei曲bor-joining算

法构建系统发育树。1.3数据处理

采用SPSS18.O软件对数据进行单因素方差分析及显著性检验。

液态发酵条件下,供试菌株对稻杆及苦参

残渣的降解效果

各菌株对稻秆和苦参残渣均表现出一定的降

解作用(图3A)。其中,木霉菌(嘶c危D如rmosp.)LA一

9对稻秆和苦参残渣的降解率最高(P<O.05),分别为32.8%和19.6%。细菌XM.3对稻秆和苦参残渣的降解率分别为24.8%和13.6%。放线菌LS.12和

2结果与分析

2.1纤维素刚果红培养基筛选菌株

分离纯化得到239株菌可以在纤维素刚果红培养基上形成清晰透明圈(图1),包含23株耐高温

TS.7对稻秆的降解率分别为21.7%和20.7%,对苦参残渣的降解率分别为8.1%和12.3%。绝大多数菌株在液态发酵条件下对稻秆的降解作用显著大

图2菌株的滤纸条崩解效果

Fnterpaperdegradationeffectofstrains

FiguI.e2

XM.3培养第2天(A)和xM一8培养第3天(C),左边为对照;Ts.3(B)和NF.2培养第9天(D),右边为对照。与对照相比,滤纸条完全崩解

xM一32dcultivated(A)andxM.83dcultivated(C),respec—

tively,theleRwascon仃ol;TS一3(B)andNF一2(D)9dcultivat.edfor,respectively,therightwascon仃01.Comparedwithn-ol,filterpaperstripesweredegradedcompletely

con—

于其对苦参残渣的降解(P<0.051。

2.3.2

XM一3、XM一8、WS一3、WS一4和TS一3在对两者的降解中也表现出了较高的活力。和液态发酵下相似,绝大多数菌株在固态发酵条件下对稻秆的降解作用

固态发酵条件下,供试菌株对稻秆及苦参残

渣的降解效果

固态发酵条件下对稻秆降解作用最强的菌株

为放线菌LS一12(图3B),降解率达到了19.O%(P<0.05)。其次,放线菌TS一7和真菌LA一9对稻秆的降解率分别为17.9%和18.3%。在供试菌株中,对苦参残渣降解作用最强的为真菌LA一9,降解率为10.3%(P<0.05)。放线菌中的LS一12和TS一7对稻秆及苦参残渣均表现出较强的降解作用,细菌中的

表1

26株菌的滤纸条崩解实验

要高于其对苦参残渣的降解。

2.4复合菌系构建

根据CMCase酶活力,滤纸条崩解能力及各菌株对稻杆和苦参残渣的降解效果,结合在堆肥过程中常温菌、耐高温菌及细菌、放线菌和真菌之间的协同作用,最终选取xM一3等12株菌作为构建复合菌系的初选菌株。其中包含了细菌、放线菌和真

Tablel

Resultsof6lterpaperstripesdegradatjonby26strains

+:滤纸软化;++:1/4降解;+++:1/2降解;++++:3/4降解;+++++:完全降解;1~3:耐高温菌:4~26:常温菌:下同

+:Fiterp印ersoRened;十+:1/4degraded;+++:l/2degraded;++++:3/4degraded;+++++:A11degraded;l~3:Hightempemtureresistantmicmo唱anisms;4~26:Mesophilicmicroo唱anisms;Thesamebelow

426淼臻当盖慧。。眦。h山纠

菌,同时也包含了常温菌和耐高温菌。这12株菌著的滤纸条崩解能力(表1);TS一3、WS.3和WS.4三之间的拮抗作用结果见表2。从表2可以看出,菌者除具有较高的滤纸条崩解能力及对稻杆和苦参株XM.3和XM.8存在拮抗作用,同时G一2、G一3和残渣的降解能力外(表l,图3和4),还具有较强的LS一12均对XM一8产生拮抗作用。菌株WS.3与G一琼胶酶活力(结果未列出);G一2、G一3和G—13均可以2、G.3、G.13及LA.9存在拮抗作用。3株耐高温菌耐受65℃的高温,G一13表现出相对较高的降解能中只有G—13与其他菌株存在较少的拮抗作用。菌力(表l,图3);放线菌TS一7和LS一12表现出较高残株TS一7和其他菌株具有较好的相容性。真菌中的渣降解活力和一定的表面活性(图3)。综上所述,LA.9与多株菌(WS一3,G一2,G一3和G一13)存在拮抗选取XM一3、TS.3、G一13、LS.12、TS一7和SLT_12这6作用。在12株初选菌株中:XM一3和XM.8具有显

株菌组建复合菌系。

习稻杆

Ricestraw

j苫参残渣Radix

residues

a旱

∞1

蔷.董z

蓁量2

234567891011121314151617l819202l2223242526

菌株Strains

图3

26株菌对稻杆及苦参残渣在液态(A)和固态(B)发酵条件下的降解效果

F蟾ure3

Degradati伽rate

ofricestrawand

mdix

residuesby26

strai璐underUquid(A)andsoIid(B)state

fe珊entation

根据邓肯多重范围检验,不同字母表示处理间存在显著差异(P<O.05),菌株编号及相关信息见表l,下同

AccordingtoDuncan’smutiplemngetest,difrerentlettersindicatesignificantdifference(P<0.05)among

treatments,StrainNo

andtheirinformations

see

T曲le

1.thesamebelow

表212株木质纤维素降解茵之间的拮抗活性

TabIe2

Theantagonisticactivitiesamong12strainswithlignocelIuIose

degmdingabiIity

菌株

XM一3XM-8TS.3

WS.4wS一3

G一2G一3

G.13

LS.12

TS.7

LA一9

SLl二12

Strains

++十

什+

一+

抖抖

抖+

抖抖

抖抖

什o名,4抖

+什抖

一一

+什

一++

++

抖一一

H+

一¨

++

Ⅲ煳;垒啪∞叭峪;查№邮3他7母u

~:具有拮抗作用;+:菌株间无明显拮抗作用但不能交叉生长;++:菌株间无拮抗作用,可以交叉生长

~:AntagonismbeMeenMo

strains;+:Nosigllmcantantagonismbet、veen

Mo

s仃ains,but

no

cmssgro、^,th;++:Nosignificant

an—

tagonism

be帆eenMo

strains,and

cmss伊。叭h

2.5单一菌株在复合菌系中的作用测定

为了用最少的菌株构建对木质纤维素降解能力尽可能强的复合菌系,通过测定不同菌株组合的滤纸酶活力和对苦参残渣的降解,进一步测定了复合菌系中单一菌株在复合菌系中发挥作用的大小。

2.5.1

系滤纸酶活力的影响较小。

2.5.2不同菌株组合对苦参残渣的降解

由图4B可知,不同菌株处理对苦参残渣的降解效果存在较大差异。不同菌株组合对苦参残渣

的降解效果均未显著低于任何单一菌株(P>O.05),

说明单一菌株所分泌酶的种类和数量有限,不及复合菌系,苦参残渣的降解需要多种酶的协同作用。

不同菌株组合的滤纸酶活力

由图4A可以看出,除Tot—LS.12外,各复合菌

系的滤纸酶活力均显著高于单一菌株(P<0.05),说

明通过构建复合菌系的方法可以显著提高菌系的滤纸酶活力水平。在单一菌株中,3株细菌(xM一3,TS一3和G一13)的滤纸酶活力要显著低于放线菌(LS一12)和真菌(SLT-12)(P<0.05),其中以真菌SLT-12的酶活力最高。复合菌系中Tot—TS一7的酶活力最高,表明放线菌TS一7在菌株群体的生长增殖过程中,可能与其他菌株存在营养或空间的竞争,从而对其他菌株产生了一定的抑制作用,导致复合菌系整体酶活力的降低。而T0t—LS—12和Tot—SLT-12与Total相比,酶活力显著降低(P<0.05),说明放线菌LS.12和真菌sLT-12在复合菌系中发挥很重要的作用,能提高整个菌系的酶活力。Tot—xM一3、Tot—TS一3和T0t—G一13三者与Totol之间的酶活力差异不显著(P>0.05),说明3株细菌的存在与否对复合菌

单一菌株处理中,真菌SLT.12对苦参残渣的降解

率显著高于其他菌株(P<0.05),而细菌TS一3对苦参残渣的降解率最低(P<0.05),说明在对天然木质纤维素材料的降解过程中真菌往往发挥重要作用。与Totol相比,Tot—LS.12、Tot—SL卫12、Tot—XM一3和Tot—TS.3的降解率均显著降低(尸<0.05),说明复合菌系中LS—12、SLT-12、xM一3和TS一3在对苦参残渣的降解中均发挥了重要作用,特别是LS一12和SLT-12。Tot—G.13与Totol对苦参残渣的降解率差异不显著(P>0.05),说明耐高温细菌G一13在复合菌系中发挥的作用较小,可能与其在常温下与其他菌株相比,竞争力不足相关;同时也说明该菌株对复合菌系中其他菌株作用的发挥没有负面影响,在堆肥的高温阶段,该菌株将发挥作用。与Totol相比,T0t—TS一7对苦参残渣的降解率显著升高(P<0.051,达到31.4%,这说明放线菌TS.7对复合菌系

一宣3

¥蜒避螺煺

12345678910ll1213

组别Groups

图4不同菌株处理发酵液的滤纸酶活力(A)和对苦参残渣的降解(B)

FigIlre4

Fp鹪eactiviti鼯(A)anddegradation

rate

ofmdixr鹪idu髂(B)ofthedi仃erentstrai璐treatedcult町e

medi岫

1:xM.3:2:TS.3;3:G.13;4:Ts.7;5:LS一12;6:sLT.12;7:除xM一3之外的其他5株菌(Tot.xM.3);8:除TS一3之外的其他5株菌(Tot.TS.3);9:除G.13之外的其他5株菌(Tot—G一13);10:除TS.7之外的其他5株菌(Tot—TS-7);11:除LS-12之外的其他5株菌(Tot.LS一12);12:除Su二12之外的其他5株菌(Tot.Su二12);13:1~6株菌的组合(Tot01);下同

l:XM.3:2:TS.3:3:G.13;4:TS一7;5:LS.12;6:S【jr-12;7:Theomer5stainswimoutxM-3(Tbt-XM一3);8:Theother5stains

withoutTS.3fTot—TS.3);9:Theother5stainswithoutG-13(Tot-G一13);10:Theother5stainswithoutother5stainswimoutLS.12(Tot—LS.12);12:Theother5stainswithout

TS一7(Tot—TS一7);11:T11e

combinationof

1~6

SL,T-12(Tot—SLT二12);13:Strain

(Tbt01);The

s锄e

below

428盏兰警譬淼。。龇。㈦咧

中其他菌株产生了一定的抑制作用,限制了其他菌

(日P咖一聊七沉∥Ⅱmi舶m厶,KP398562),Ts-3为微杆菌属(心cr060c把riMmsp.,Ⅺ139435),G一13为芽胞杆菌

对苦参残渣的有效降解。

综上表明,复合菌系中去掉放线菌TS一7就可以有效提高整个复合菌系的滤纸酶活力和对苦参残渣的降解能力。本研究最终确定将xM一3、TS一3、G一13、LS—12和SLT-12作为构建复合菌系的最终菌株。

将上述5株菌按照体积比1:l混合接种于固体稻秆降解培养基,发酵20d后测得稻秆的失重率为

63.1%。

属∞oc谢凇sp.,Ⅺ139434),LS—12为链霉菌属(S£即一

£o哗es

sp.,IUl39431)(图5),SLT-12为毛壳菌属

(吼。e£omiumsp.,KM098053)(图6)。

3讨论

木质纤维素降解菌的筛选中,应根据筛选目的

和筛选所处阶段灵活采用多重评价标准。不同微生物特性不同,表现出来的酶活力与其对底物的降

2.6菌株鉴定结果

根据形态学,生理生化及16SrRNA或ITS区序列比对结果表明,xM一3为弗留明拜叶林克氏菌

解能力间的相关性存在差异,微生物对真实底物的降解往往最能反映其实际应用潜力。本研究中,供试菌株在液态酵条件下对稻秆的降解效果普遍高

图5

xM-3、TS.3、G.13和LS.12的16SrRNA基因序列系统发育树

Phyloge耻tictr∞0fXM-3,TS-3,G-13and

LS-1216S

FigIlre5

rI斟Agenesequenc鹤

于对苦参残渣的降解(P<0.05),这与苦参残渣中木质素含量高且含有某些抑菌化学成分相关(杨雪云

理优化组合来构建复合菌系可以达到高效降解木质纤维素的目的。研究表明,单一的细菌、真菌和放线菌尽管活性较高,但在加速堆肥化进程中的效果却不如复合微生物菌群的共同作用,自然界中木质素纤维素的降解是真菌、细菌及相应微生物群落

等,2008),同时也说明微生物对不同底物的降解能力和适应性存在差异。研究显示,细菌和真菌降解

木质纤维素的机理不同,真菌主要靠分泌多种胞外酶对木质纤维素进行降解;而大多数细菌对木质纤维素的降解是通过细胞表面酶进行的,需要附着在木质纤维素表面上才能将其降解(李振红,陆贻通,2003)。本研究中,在复合菌系中分别除去细菌XM.3、TS一3和G一13前后的滤纸酶活力相比差异不显著(P>0.05),这可能与大多细菌本身胞外酶活力低相关(Rabinovich

et

共同作用的结果(蒋荣清等,2010)。崔宗均等

(2002)利用酸碱互补的原则驯化得到高效复合菌系MCl,该复合菌系在72h对滤纸的降解率为94.0%。邱向阳等(2003)在秸秆堆肥中以纤维素为唯一碳源筛选得到一批具有较高纤维素降解能力的微生物,通过正交实验得到4组复合菌剂可以在

a1.,2002;赵彩云等,2009)。

d内快速启动滤纸条降解。王伟东等(2005)利用

发酵液的酶活只能反映胞外酶活力大小,而非微生物对木质纤维素的降解能力。滤纸聚合度和结晶度中等,接近天然纤维素,滤纸酶活反映了纤维素酶的总糖化能力(傅力等,2000),因而在纤维素降解菌的筛选中被广泛采用,同时也便于不同研究之间效果的比较。然而,微生物对天然木质纤维素材料的降解会更直接反映其降解能力及实际应用潜力。本研究中供试的4株真菌(LA一4,LA.9,Lx一1和SLT-12,图3)在液态发酵条件下对稻秆和苦参残渣均表现出较高的降解效果(P<0.05),而细菌和放线菌中仅有少数菌株对两者的降解效果相对较高,这说明真菌在木质纤维素的降解中通常发挥重要作用。此外,本研究采用CMCase酶活、滤纸条

限制性培养技术经过多代驯化及优化得到高效复合菌系WSC.6,该复合菌系在72h内对滤纸的降解率为97.0%,对稻杆的降解率为28.2%。崔诗法等(2009)从枯枝落叶中分离到一组纤维素分解复合菌系St一13,该复合菌系由平板可分离细菌和难培养细菌组成,该复合菌系5d可使滤纸完全崩溃;本研究构建的复合菌系中菌株xM一3,可以在

48

h内将滤纸条完全崩解,效果强于上述己报道菌

株及菌株组合:经鉴定,菌株xM一3经鉴定为弗留

明拜叶林克氏菌,为一种固氮菌,这也是首次报道该菌具有较强的纤维素酶活和滤纸条崩解能力,后续可以开展该菌在降解纤维素过程中的固氮作用研究。刘甲锋等(2010)采用限制性培养技术与温度梯度诱导相结合的方法从土壤中筛选、构建出一组在中温条件下对水稻秸秆具有腐解功能的复合菌系RSS一4,该复合菌系腐解16d对稻秆、纤维素及半纤维素的降解率分别达到了45.0%、55.5%和44.1%。Yang等(2004)构建了一组由里氏木霉

崩解、对苦参和稻秆在液体和固态发酵下的降解等多重标准评价各菌株的活力,同时通过在复合菌系

中剔除某株菌来研究该菌株在复合菌系中的作用及其对其他菌株的影响,为木质纤维素降解菌的筛选及复合菌系的构建提供了一条有效途径。

将不同特性的高效木质纤维素降解菌通过合

(nic^o如r,礼口rees反)、黑曲霉(A5卵卿ZZ榔n橱er)和酒

图6真菌SLT.12的ITS区基因序列系统发育树

FigIlre6

Phyloge眦tic

tr∞of劬giSLT-12b嬲ed

on

ITSgenesequen∞s

430惫鉴警譬盖煞。眦。酬。科

精酵母(&cc^口rDm”esceM厶i口∞)组成的复合菌系,该复合菌系的最高滤纸酶活力为5.64U/g,对稻壳

的降解率为28.05%。林捷等(2006)用6株相互间无拮抗作用的纤维素分解菌进行混合发酵,大幅度提高了纤维素酶活力及对还原糖的耐受力。本研究中,通过构建复合菌系混合发酵培养,显著提高了其滤纸酶活力和对苦参残渣及稻秆的降解效果(P<0.05)。最终得到的复合菌系对苦参残渣和稻秆固态发酵20d的降解率分别达到31.4%和63.1%。苦参提取残渣和中药提取残渣一样,代表了一大类工业生产有机固体废弃物,此类废弃物木质纤维素含量高,堆肥化处理困难,关于此类物质处理的报道极少,本研究通过将不同菌株组合构建复合菌系显著提高了微生物对此类物质的降解,为堆肥化处理此类物质、开发堆肥接种剂提供了一条有效途径。同时,本研究所构建的复合菌系只有5株菌组成,生产工序简单,质量容易控制,在实际生产应用中操作性强。

4结论

本研究通过纤维素刚果红选择性培养基初筛得到大量纤维素降解菌,然后经过滤纸条崩解实验,对苦参残渣和稻杆在液态和固态发酵条件下的降解实验,层层筛选,最后通过拮抗和组合实验,最终构建了由弗留明拜叶林克氏菌、微杆菌属、芽胞杆菌属、链霉菌属和毛壳菌属5株菌组成的复合菌系。该复合菌系单一菌株活性高,对稻杆和苦参残渣具有较强的降解能力,且效果不比通过直接筛选法得到的复合菌系效果差;同时该复合菌系菌株组成简单、各菌株特性明确、在实际应用中质量容易

控制、实用性强,为堆肥接种剂的开发提供了一条

新的途径。

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(责任编辑

马丽萍)

高效纤维素降解菌的筛选及复合菌系的构建

作者:

作者单位:刊名:英文刊名:年,卷(期):

王海滨, 韩立荣, 冯俊涛, 张兴, WANG Hai-Bin, HAN Li-Rong, FENG Jun-Tao, ZHANG Xing陕西省生物农药工程技术研究中心,杨凌712100;西北农林科技大学植保资源与病虫害治理研究中心,杨凌712100

农业生物技术学报

Journal of Agricultural Biotechnology2015,23(4)

引用本文格式:王海滨.韩立荣.冯俊涛.张兴.WANG Hai-Bin.HAN Li-Rong.FENG Jun-Tao.ZHANG Xing 高效纤维素降解菌的筛选及复合菌系的构建[期刊论文]-农业生物技术学报 2015(4)


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