总RNA 提取的原理、步骤
1. 原理及方法(异硫氰酸胍-酚-氯仿 一步法)
TRIZOL试剂中的主要成分为异硫氰酸胍和苯酚,其中异硫氰酸胍可裂解细胞,促使核蛋白体的解离,使RNA 与蛋白质分离,并将RNA 释放到溶液中。当加入氯仿时,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA 进入水相,离心后可形成水相层和有机层,这样RNA 与仍留在有机相中的蛋白质和DNA 分离开。水相层(无色)主要为RNA ,有机层(黄色)主要为DNA 和蛋白质。
2. 简易步骤
细胞或组织,加入0.4ml TRIZOL试剂后匀浆
↓
室温静置5分钟
↓
加入1/5 TRIZOL 试剂体积量的氯仿,剧烈震荡混匀
↓
室温静置5分钟,12000g 4℃离心l5分钟
↓
将上清液转移至新的离心管中,加入与上清液等体积的异丙醇,颠倒混匀
↓
室温静置10分钟,12000g 4℃离心l0分钟,弃上清
↓
向沉淀中加入1ml 的75%乙醇清洗沉淀,12000g 4℃离心5分钟
↓
弃上清保留沉淀,干燥
↓
沉淀物溶解于11μl 的DEPC 处理水中
↓
注意:以上操作应在生物安全柜内完成,以防止污染。
注意事项
①全程配戴一次性手套。皮肤经常带有细菌和霉菌,可能污染RNA 的抽提并成为RNA 酶的来源。培养良好的微生物实验操作习惯预防微生物污染。
②使用灭菌的,一次性的塑料器皿和自动吸管抽提RNA ,避免使用公共仪器所导致的RNA 酶交叉污染。
③在TRIZOL 中,RNA 是隔离在RNA 酶污染之外的。而对样品的后续操作会要求用无RNA 酶的非一次性的玻璃器皿或塑料器皿。玻璃器皿可以在150°C 的烘箱中烘烤4小时。塑料器皿可以在0.5 M NaOH中浸泡10分钟,用水彻底漂洗干净后高压灭菌备用。
④用TRIZOL 抽提RNA 时要戴手套和护眼罩。避免接触皮肤和衣服。在化学通风橱完成操作。避免呼吸道吸入。如无例外,所有的操作应该在15 -30°C 的条件下完成,试剂亦在15 -30°C 的条件下。
⑤75%乙醇(用DEPC 处理过的水配制:将水加入无RNA 酶的玻璃瓶中,加入DEPC 至0.01% (v/v)。放置过夜并高压灭菌。)
⑥每50—100 mg组织加1ml 的TRIZOL 。匀浆化时组织样品容积不能超过TRIZOL 容积的10%。 ⑦单层生长的细胞 直接往直径3.5 cm的培养板中加入1ml 的TRIZOL 溶解细胞,通过移液管分次移出细胞裂解物。依据培养板的面积而不是依据细胞的数量来决定所需的TRIZOL 量(每10 cm2加1 ml)。当TRIZOL 量不足时可导致抽提的RNA 中污染有DNA 。
⑧在匀化后和加入氯仿之前,样品可以在–60—–70°C 保存至少一个月。RNA 沉淀(RNA 洗脱)溶于75%的乙醇在2—8°C 至少可以保存一周,在–5—–20°C 下至少可保存一年。
逆转录cDNA 及注意事项
如果cDNA 当天不使用,则要保存在-20℃或-70℃。
RNA 逆转录成cDNA 操作流程简图如下:(在冰盒上操作)
1. 将提取的RNA 溶解于11 μl DEPC-t净化水中, 加入1ul 引物,1ul 模板RNA ,1uldNTP 轻微震荡后离心3-5秒。
2. 在PCR 扩增仪上70℃ 5分钟。
3. 冰上冷却1分钟,并短暂离心,向反应体系中加入5×reaction buffer 4μl ,RibolockTM Ribonuclease inhibitor (20 u/μl) 1μl ,10 mM dNTP mix 2μl 。
4. 轻微震荡后离心3-5秒,在PCR 扩增仪上37℃ 5分钟。
5. 向反应体系中加入RevertAidTM M-MuLV Reverse Transcriptase (200u/ul) 1μl ,在PCR 扩增仪上42℃ 60分钟进行逆转录,70℃ 10分钟灭活逆转录酶。
6. 收集反应产物,冰上冷却
总RNA 提取的原理、步骤
1. 原理及方法(异硫氰酸胍-酚-氯仿 一步法)
TRIZOL试剂中的主要成分为异硫氰酸胍和苯酚,其中异硫氰酸胍可裂解细胞,促使核蛋白体的解离,使RNA 与蛋白质分离,并将RNA 释放到溶液中。当加入氯仿时,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA 进入水相,离心后可形成水相层和有机层,这样RNA 与仍留在有机相中的蛋白质和DNA 分离开。水相层(无色)主要为RNA ,有机层(黄色)主要为DNA 和蛋白质。
2. 简易步骤
细胞或组织,加入0.4ml TRIZOL试剂后匀浆
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室温静置5分钟
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加入1/5 TRIZOL 试剂体积量的氯仿,剧烈震荡混匀
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室温静置5分钟,12000g 4℃离心l5分钟
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将上清液转移至新的离心管中,加入与上清液等体积的异丙醇,颠倒混匀
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室温静置10分钟,12000g 4℃离心l0分钟,弃上清
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向沉淀中加入1ml 的75%乙醇清洗沉淀,12000g 4℃离心5分钟
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弃上清保留沉淀,干燥
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沉淀物溶解于11μl 的DEPC 处理水中
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注意:以上操作应在生物安全柜内完成,以防止污染。
注意事项
①全程配戴一次性手套。皮肤经常带有细菌和霉菌,可能污染RNA 的抽提并成为RNA 酶的来源。培养良好的微生物实验操作习惯预防微生物污染。
②使用灭菌的,一次性的塑料器皿和自动吸管抽提RNA ,避免使用公共仪器所导致的RNA 酶交叉污染。
③在TRIZOL 中,RNA 是隔离在RNA 酶污染之外的。而对样品的后续操作会要求用无RNA 酶的非一次性的玻璃器皿或塑料器皿。玻璃器皿可以在150°C 的烘箱中烘烤4小时。塑料器皿可以在0.5 M NaOH中浸泡10分钟,用水彻底漂洗干净后高压灭菌备用。
④用TRIZOL 抽提RNA 时要戴手套和护眼罩。避免接触皮肤和衣服。在化学通风橱完成操作。避免呼吸道吸入。如无例外,所有的操作应该在15 -30°C 的条件下完成,试剂亦在15 -30°C 的条件下。
⑤75%乙醇(用DEPC 处理过的水配制:将水加入无RNA 酶的玻璃瓶中,加入DEPC 至0.01% (v/v)。放置过夜并高压灭菌。)
⑥每50—100 mg组织加1ml 的TRIZOL 。匀浆化时组织样品容积不能超过TRIZOL 容积的10%。 ⑦单层生长的细胞 直接往直径3.5 cm的培养板中加入1ml 的TRIZOL 溶解细胞,通过移液管分次移出细胞裂解物。依据培养板的面积而不是依据细胞的数量来决定所需的TRIZOL 量(每10 cm2加1 ml)。当TRIZOL 量不足时可导致抽提的RNA 中污染有DNA 。
⑧在匀化后和加入氯仿之前,样品可以在–60—–70°C 保存至少一个月。RNA 沉淀(RNA 洗脱)溶于75%的乙醇在2—8°C 至少可以保存一周,在–5—–20°C 下至少可保存一年。
逆转录cDNA 及注意事项
如果cDNA 当天不使用,则要保存在-20℃或-70℃。
RNA 逆转录成cDNA 操作流程简图如下:(在冰盒上操作)
1. 将提取的RNA 溶解于11 μl DEPC-t净化水中, 加入1ul 引物,1ul 模板RNA ,1uldNTP 轻微震荡后离心3-5秒。
2. 在PCR 扩增仪上70℃ 5分钟。
3. 冰上冷却1分钟,并短暂离心,向反应体系中加入5×reaction buffer 4μl ,RibolockTM Ribonuclease inhibitor (20 u/μl) 1μl ,10 mM dNTP mix 2μl 。
4. 轻微震荡后离心3-5秒,在PCR 扩增仪上37℃ 5分钟。
5. 向反应体系中加入RevertAidTM M-MuLV Reverse Transcriptase (200u/ul) 1μl ,在PCR 扩增仪上42℃ 60分钟进行逆转录,70℃ 10分钟灭活逆转录酶。
6. 收集反应产物,冰上冷却