・319・
.综述.
乙型脑炎病毒反向遗传技术研究进展
李佳,朱武洋,王兰,粱国栋
乙型脑炎病毒能够引起流行性乙型脑炎,该病可引起人类永久性中枢神经系统后遗症,且致死率较高。该病毒免疫逃逸、跨越血脑屏障及其跨种阃传播与感染等机制尚不清楚.而反向遗传技术对于阐明乙脑病毒致病分子机理、研制重组病毒疫苗及开发基因工程载体是蕈要的技术手段。本文将就乙脑病毒反向遗传技术的研究状况、限制因素及应用加以综述。
l
前言
流行性乙型脑炎(Japaneseencephalitis,JE)是由乙型脑
炎病毒(Japaneseencephalitisvirus.JEV)引起的病毒性脑炎,主要流行于亚洲和太平洋地区¨工1。每年有35000—50000
人患病.死产10
000—15
000人¨’。全世界大约30亿人生活
在乙脑流行区…,加之每年大量的旅游者到乙脑流行区域旅
行而使患病牢增加。提示乙脑已经成为危害人类生命和财
产安全的莺要公共卫生问题。目前。乙脑病毒的基因组结构已得到证实,但乙脑的发病机制,特别是乙腩病毒免疫逃逸、跨越血脑屏障及其跨种间传播与感染的分子机制一直不清。
乙型脑炎病毒简称乙脑病毒,隶属于黄病毒科(flaviviridae)黄病毒属(flavivirus)。该病毒基冈组序列已被完整的测定出来,57末端有一个帽子结构即m7G(5’)PPP(5’)ApUp.3’末端没有polyA.而是以CU-OH为尾巴¨J。在病毒的复制、翻译和病毒颗粒包装的过程中,5’和3’末端非编码区起到了不可或缺的作用。在5’和3’端非编码区之间的单一开放阅读框(open
reading
frame.ORF)编码约3432
个氮基酸残基的多聚蛋白.自5’至3’端依次为三种结构蛋白C、prM和E以及七种非结构蛋白NSI、NS2A、NS2B、NS3、NS4A、NS4B和NS5㈩。
’
由于乙脑病毒属于非逆转录RNA病毒,其复制过程中
不形成中间体DNA.因此直接对病毒基因组RNA进行基因工程操作存在一定的困难。乙脑病毒反向遗传技术是指由
DOI:10.3760/cma.j.issn.1003-9279.201I.04.027
基金项目:国家自然科学基金项目(30970160);传染病预防控制国家蕈点实验室(20IlSKLID205):重大传染病防治科技重大专项项目(2008ZXl0004-001;2009ZXl0004-705)
作者单位:030006
太原,山西大学生命科学学院(李佳、壬
兰):中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所(朱武洋、粟围栋)
通信作者:王兰.Email:[anwang@SXU.edu.cn;粱国栋。Email:
gdliang@hotmml.com
万方数据
病毒来源的cDNA克隆获得恢复病毒的技术,该平台为阐明
乙脑病毒致病分子机理、研制病毒疫苗和开发基因工程载体等研究奠定了物质基础。本研究将就乙脑病毒反向遗传技术的研究状况、限制因素及应用加以综述。
2乙脑病毒反向遗传系统的研究状况2.1
国外研究状况
最早研究JEV反向遗传技术的是
Sumiyoshi等”1,1992年该研究小组通过RT—PCB方法扩增
获得了JEV基因组全长eDNA的两个半分子,这两个片段的
长度分别为5576bp和5400bp。将这两个半分子片段分别克隆至载体中获得了两个JEV亚基因组克隆(M343和
H756).起初该小组把半分子片段经体外连接获得的JEV全
长eDNA克隆至pBR322载体中。期望经体外转录获得具有感染性的RNA转录本。但实验没有获得成功.其原因可能是JEV基因组全长eDNA,尤其是基因组5’末端对大肠埃希菌有毒性,使JEV基因组在宿主菌中不稳定。为解决这一问题,Sumiyoshi等直接将JEV两个半分子连接成基因组全长eDNA。为对恢复病毒进行鉴定,在全长eDNA的3’末端非编码区9131bp处加入了单一酶切位点XbaI,使恢复病毒具有与亲本病毒不同的分子标识。以此eDNA为模板转录出的RNA转染BHK.21细胞后获得了恢复病毒.且经酶切鉴定的恢复病毒与亲本病毒的生长曲线、在BHK一21细胞一|:的空斑表型、在C6/36细胞内的信号肽表达及其神经毒性等生物学特性均较为相似∞1。
为了克服JEV全长eDNA克隆在宿主菌中的不稳定性。Sang-Im等¨1以细菌人工染色体(bacterial
artificial
chromosomes,BACs)为载体构建了JEV感染性克隆。将JEV全长eDNA克隆到细菌人工染色体.然后以其为模板进行体外转录,所获得的转录本RNA的感染力大约为lO’一106PFU/m1.转染宿主细胞后所获得的恢复病毒的滴度可达
106—107PFU/ml。而且所获得的恢复病毒和亲本病毒在感
染性、致病性等生物学特性上具有相似性油’。另外,在重组
BACs上对JEV基因组上进行点突变后,测序鉴定结果表明恢复病毒来自于该感染性eDNA克隆‘“。这也再次证明可通过反向遗传技术从分子水平上对JEV基因组进行改造和应用。
2.2国内研究状况
黄庆生等利用长模板RT-PCR法,一
次扩增出SAl4株JEV的基因组全长eDNA片段,并使用大片段克隆技术将其克隆于黏粒载体的RNA聚合酶启动子下游。所使用的黏粒载体克隆位点两端具有17和SP6启动
・320・
子,可根据不同的插入方向在体外转录时选择相应的RNA聚合酶。以该重组载体为模板经体外转录可获得病毒的全长转录本RNA,采用脂质体转染法转染BHK细胞后,转录本
RNA可使细胞产生病变,经乳鼠脑内接种及特异性免疫荧
光染色证明为JEV。这一结果说明该克隆具有一定的感染性…。另外,以一条含有RNA聚合酶启动子序列的5’引物
为基础,利用长模板RT—PCR方法一次扩增出带有启动子的基因组全长eDNA,该小组以其为模板也获得了具有感染性的转录本RNA【7J。曾明等¨’利用类似的方法也获得了.JEV
减毒株SAl4.14.2的恢复病毒。
黄莺等一1利用RT.PCR法扩增出JEV减毒株SAl4-14-2
的4个片段,并将其分别克隆到质粒载体中,进~步构建两
个半端分子克隆.最终将全长cDNA克隆到改造过的载体
pBR—kpn中,并选取一个生长相对缓慢的JMl09菌株为宿主菌。经体外转录得到的RNA转录本采用脂质体转染法转染BHK一21细胞后。获得了JEV恢复病毒。实验结果证实恢复
病毒在生物学特性、分子生物学和蛋白表达水平等几个方匾
与亲本病毒基本一致。
3乙脑病毒感染性克隆构建的限翩因素
全长cDNA克隆的不稳定性是黄病毒属病毒反向遗传
系统构建工作最重要的限制性因素。已有研究表明,通过
RT—PCR、体外连接等方法可以获得黄病毒基因组全长eDNA克隆,但是由于对大肠埃希菌的毒性或其他因素,使得全长
克隆不稳定而导致感染性eDNA克隆构建工作的失败。豌豆早桔病毒(peaearly—browningvirus)、茄子花叶病毒
(eggplant
mosaic
virus)以及甜菜坏死黄脉病毒(beet
necrotic
yellowveinvirus)的反向遗传研究中也存在类似问题¨…。
已有研究工作表明,可以通过选择合适的载体、菌株等方法克服这一限制因素。3.1载体选择黄病毒属病毒主要包括JEV、黄热病毒(yellow
fever
virus,YFV)和登革病毒(Denguevirus,DENV)
等,基因组全长eDNA在宿主细胞中的不稳定性严重阻碍了
黄病毒反向遗传技术的研究进展。在黄病毒属病毒中,YFV是感染性克隆构建较为成功的成员之一。Rice等…1在黄热病毒两个亚基因组克隆,即pYF5’3’IV和pYFM5.2的基础上经体外连接构建了病毒全长eDNA片段,以其为模板经体外转录和转染获得了恢复病毒。黄病毒也是第一个使用体外
连接方法获得感染性转录本RNA的病毒。载体pACYCl77
是一低拷贝质粒,以该载体为骨架成功构建了鼠疫病毒感染性eDNA克隆1120”。低拷贝质粒pACNRIl80是在pACYCl77质粒的基础上改造而来的。Rice等…1以pACNRll80为载体成功获得了YF-17D的全长eDNA克隆pACNR/FLYF-17Dx。以其为模板转录出的RNA转录本经脂
质体转染后的病毒滴度可达105—106
ph/¨g
RNA。且
pACNR/FLYF.17Dx克隆来源的恢复病毒与亲本病毒具有相
似的蛋白水解动力学曲线、病毒RNA合成和生长曲线¨“。
万方数据
解决JEV全长cDNA在细菌体内的潜在毒性和不稳定性的问题,可以通过选择合适的克隆载体得以解决。通常而言,
携带外源长片段的载体会对宿主表现出一定程度的限制性,而基冈组eDNA在中、低拷贝的克隆载体中较稳定¨…。过
去各种载体系统试图用于装配JEV全长eDNA,包括大肠埃希菌的黏性末端质粒载体,结果表明cDNA克隆在遗传学上
均不稳定¨’”。“。与之类似.以高拷贝PUC质粒和中拷贝
pBR322载体为骨架构建JEVCNU/LP2全长eDNA克隆的工作也是失败的∞o。与此相比,Sang.Im等阳1将JEV
cDNA
克隆在低拷贝的BACs载体上(每个大肠埃希菌细胞中只有1或2拷贝),获得了稳定的JEV感染性cDNA克隆,在大肠
埃希菌中增殖180代后其遗传学结构和功能依然稳定。类
似的低拷贝载体在一些其他黄病毒感染性克隆构建工作中
也有报道,如蜱传脑炎病毒(tick.borne
encephalitis
virus,
TBEV)¨副和墨累溪谷脑炎病毒(murrayvalley
encephalitis
virus.MVEV)”…。这些研究均表明,选择BACs、pACNRll80质粒等低拷贝载体是黄病毒感染性全长eDNA克隆构建工作的重要策略之一,而这对于构建JEV全长eDNA克隆具有
一定的借鉴意义。
3.2其他因素除了选择合适的载体之外,宿主菌、克隆方
法的选择同样对JEV等黄病毒感染性全长eDNA克隆构建工作至关重要。研究结果表明选择生长相对较为缓慢的宿
主菌,如DH5a、JMl09及MCl061等,可以有效提高JEV基
因组eDNA的稳定性Ⅲ1。此外,选择合理的克隆方法有助于感染性克隆的构建。感染性克隆的构建方法主要有三种,
第一种方法是运用RT—PCR方法分段扩增出JEV基因组
eDNA片段,将得到的eDNA片段分段连人载体后得到全长eDNA模板用于转录"’11,tsj,这种方法规避了病毒eDNA基因组的不稳定问题,但实用性较筹,较为繁琐费时。第二种方法是利用高保真长片段RT-PCR法获得含有SP6或17启
动子的全长eDNA,这种方法虽然简便快捷,但对试剂品质
要求较高,而且难以对病毒基因组进行定点突变旧“。第三种则是在选择合适的载体和宿主菌的前提下运用融合PCR法分段获得JEV基因组eDNA片段。然后经体外连接得到JEV基因组全长eDNA后将全长eDNA连入载体中的方法。4乙脑病毒反向遗传技术的应用
4.1基础研究反向遗传技术是研究RNA病毒基因组结构和功能之间关系的新兴技术。JEV反向遗传技术可被广泛应用于基础理论研究和实践生产研究领域。在基础研究方面,反向遗传技术可以帮助我们研究JEV复制、转录及转
染的分子机制,也可以确定JEV神经毒力和发病机制相关的毒力位点。Sang.1m等¨’利用反向遗传技术对JEV的3’末端进行了研究,研究表明具有3’末端保守序列的RNA转
录本的感染性比经过反向遗传技术改造后的3’末端具有3
或4个与病毒核苷酸序列无关的RNA转录本要高lO倍。
刘欣玉等旧引利用反向遗传技术对JEVSA4及SAl4的神经
毒力进行了研究,SA4的氨基酸序列与SAl4存在17个位点
的差异。而SA4的神经毒力比SAl4强,说明了这17个差异
氨基酸位点口r能影响着JEV的神经毒力。而JEV免疫逃逸、跨越血脑屏障及其跨种问传播与感染等分子机制的进一
步探索也离不开JEV反向遗传技术平台。
4.2载体开发通过反向遗传技术可以将JEV感染性克隆改造成RNA型或DNA型的复制子载体,这些载体在真核细胞乍物学研究巾广泛应用.是表达外源基因极有价值的遗传
学丁具。作为RNA型病毒载体,外源基冈在体内有效表达
的载体系统是研究基因治疗和疫苗的重要策略,日前常用DNA病毒载体、逆转录病毒载体或裸DNA,而RNA病毒载
体的应用则提供r另一种研究途径。与常用的DNA病毒载
体相比,RNA病毒载体的基闪组小,构建和操作较为方便,其生命周期中不经历DNA阶段,不会整合到宿主细胞染色体从而引起低水平表达或基因沉默,不会改变物种的遗传性。Sang—lm等【61将两个代表性的报告基因绿色荧光蛋白
(greenfluorescentprotein,GFP)和荧光索酶(1ucifecase)插入
JEV基因组RNA后转染BHK-2l细胞,两个报告基因均得到
了表达。由此可知,JEV感染性eDNA在表达外源基因时起
到了真核表达载体的作用。
4.3重组疫苗研发减毒己脑重组疫苗是经过定向操纵感染性JEVeDNA克隆,从而产生孽组JEV。如JEV的E蛋白中的1个氨肇酸就是这样被证实为毒力相关位点,当JEV的E—138位点谷氨腋突变为赖氨酸时,突变株的毒力比原毒株减弱¨…。嵌合疫苗是在JEV基因组感染性克隆基础卜,将不同病毒抗原基因嵌合在一起,使之在体内产生有感染性的病毒粒子。因此,反向遗传技术为JEV的相关研究提供了有利的生物学工具。
总之,反向遗传技术是研究病毒分子机制和遗传学原理的技术平台,本综述概述了JEV反向遗传技术的研究状况、限制因素及其在基础研究等领域巾的应用。如何构建稳定的全长eDNA仍是JEV反向遗传技术尚待解决的核心问题。尽管JEV感染性RNA可以通过全长cDNA克隆获得,但是当eDNA克隆在宿主细胞中复制时容易引入突变。而体外连接获得的全长eDNA模板在遗传学七具有稳定性,但是体外连接方法费时、费力,实际应用价值不大。已有研究丁作表明,选用BACs、pACNRll80质粒等中低拷D!载体是解决黄病毒全长eDNA在细荫体内潜在毒性和不稳定性的重要策略之一。而这对于构建JEV感染性全长eDNA克隆具有一定的借鉴意义。
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(收稿日期:201l-05-26)
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l
前言
流行性乙型脑炎(Japaneseencephalitis,JE)是由乙型脑
炎病毒(Japaneseencephalitisvirus.JEV)引起的病毒性脑炎,主要流行于亚洲和太平洋地区¨工1。每年有35000—50000
人患病.死产10
000—15
000人¨’。全世界大约30亿人生活
在乙脑流行区…,加之每年大量的旅游者到乙脑流行区域旅
行而使患病牢增加。提示乙脑已经成为危害人类生命和财
产安全的莺要公共卫生问题。目前。乙脑病毒的基因组结构已得到证实,但乙脑的发病机制,特别是乙腩病毒免疫逃逸、跨越血脑屏障及其跨种间传播与感染的分子机制一直不清。
乙型脑炎病毒简称乙脑病毒,隶属于黄病毒科(flaviviridae)黄病毒属(flavivirus)。该病毒基冈组序列已被完整的测定出来,57末端有一个帽子结构即m7G(5’)PPP(5’)ApUp.3’末端没有polyA.而是以CU-OH为尾巴¨J。在病毒的复制、翻译和病毒颗粒包装的过程中,5’和3’末端非编码区起到了不可或缺的作用。在5’和3’端非编码区之间的单一开放阅读框(open
reading
frame.ORF)编码约3432
个氮基酸残基的多聚蛋白.自5’至3’端依次为三种结构蛋白C、prM和E以及七种非结构蛋白NSI、NS2A、NS2B、NS3、NS4A、NS4B和NS5㈩。
’
由于乙脑病毒属于非逆转录RNA病毒,其复制过程中
不形成中间体DNA.因此直接对病毒基因组RNA进行基因工程操作存在一定的困难。乙脑病毒反向遗传技术是指由
DOI:10.3760/cma.j.issn.1003-9279.201I.04.027
基金项目:国家自然科学基金项目(30970160);传染病预防控制国家蕈点实验室(20IlSKLID205):重大传染病防治科技重大专项项目(2008ZXl0004-001;2009ZXl0004-705)
作者单位:030006
太原,山西大学生命科学学院(李佳、壬
兰):中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所(朱武洋、粟围栋)
通信作者:王兰.Email:[anwang@SXU.edu.cn;粱国栋。Email:
gdliang@hotmml.com
万方数据
病毒来源的cDNA克隆获得恢复病毒的技术,该平台为阐明
乙脑病毒致病分子机理、研制病毒疫苗和开发基因工程载体等研究奠定了物质基础。本研究将就乙脑病毒反向遗传技术的研究状况、限制因素及应用加以综述。
2乙脑病毒反向遗传系统的研究状况2.1
国外研究状况
最早研究JEV反向遗传技术的是
Sumiyoshi等”1,1992年该研究小组通过RT—PCB方法扩增
获得了JEV基因组全长eDNA的两个半分子,这两个片段的
长度分别为5576bp和5400bp。将这两个半分子片段分别克隆至载体中获得了两个JEV亚基因组克隆(M343和
H756).起初该小组把半分子片段经体外连接获得的JEV全
长eDNA克隆至pBR322载体中。期望经体外转录获得具有感染性的RNA转录本。但实验没有获得成功.其原因可能是JEV基因组全长eDNA,尤其是基因组5’末端对大肠埃希菌有毒性,使JEV基因组在宿主菌中不稳定。为解决这一问题,Sumiyoshi等直接将JEV两个半分子连接成基因组全长eDNA。为对恢复病毒进行鉴定,在全长eDNA的3’末端非编码区9131bp处加入了单一酶切位点XbaI,使恢复病毒具有与亲本病毒不同的分子标识。以此eDNA为模板转录出的RNA转染BHK.21细胞后获得了恢复病毒.且经酶切鉴定的恢复病毒与亲本病毒的生长曲线、在BHK一21细胞一|:的空斑表型、在C6/36细胞内的信号肽表达及其神经毒性等生物学特性均较为相似∞1。
为了克服JEV全长eDNA克隆在宿主菌中的不稳定性。Sang-Im等¨1以细菌人工染色体(bacterial
artificial
chromosomes,BACs)为载体构建了JEV感染性克隆。将JEV全长eDNA克隆到细菌人工染色体.然后以其为模板进行体外转录,所获得的转录本RNA的感染力大约为lO’一106PFU/m1.转染宿主细胞后所获得的恢复病毒的滴度可达
106—107PFU/ml。而且所获得的恢复病毒和亲本病毒在感
染性、致病性等生物学特性上具有相似性油’。另外,在重组
BACs上对JEV基因组上进行点突变后,测序鉴定结果表明恢复病毒来自于该感染性eDNA克隆‘“。这也再次证明可通过反向遗传技术从分子水平上对JEV基因组进行改造和应用。
2.2国内研究状况
黄庆生等利用长模板RT-PCR法,一
次扩增出SAl4株JEV的基因组全长eDNA片段,并使用大片段克隆技术将其克隆于黏粒载体的RNA聚合酶启动子下游。所使用的黏粒载体克隆位点两端具有17和SP6启动
・320・
子,可根据不同的插入方向在体外转录时选择相应的RNA聚合酶。以该重组载体为模板经体外转录可获得病毒的全长转录本RNA,采用脂质体转染法转染BHK细胞后,转录本
RNA可使细胞产生病变,经乳鼠脑内接种及特异性免疫荧
光染色证明为JEV。这一结果说明该克隆具有一定的感染性…。另外,以一条含有RNA聚合酶启动子序列的5’引物
为基础,利用长模板RT—PCR方法一次扩增出带有启动子的基因组全长eDNA,该小组以其为模板也获得了具有感染性的转录本RNA【7J。曾明等¨’利用类似的方法也获得了.JEV
减毒株SAl4.14.2的恢复病毒。
黄莺等一1利用RT.PCR法扩增出JEV减毒株SAl4-14-2
的4个片段,并将其分别克隆到质粒载体中,进~步构建两
个半端分子克隆.最终将全长cDNA克隆到改造过的载体
pBR—kpn中,并选取一个生长相对缓慢的JMl09菌株为宿主菌。经体外转录得到的RNA转录本采用脂质体转染法转染BHK一21细胞后。获得了JEV恢复病毒。实验结果证实恢复
病毒在生物学特性、分子生物学和蛋白表达水平等几个方匾
与亲本病毒基本一致。
3乙脑病毒感染性克隆构建的限翩因素
全长cDNA克隆的不稳定性是黄病毒属病毒反向遗传
系统构建工作最重要的限制性因素。已有研究表明,通过
RT—PCR、体外连接等方法可以获得黄病毒基因组全长eDNA克隆,但是由于对大肠埃希菌的毒性或其他因素,使得全长
克隆不稳定而导致感染性eDNA克隆构建工作的失败。豌豆早桔病毒(peaearly—browningvirus)、茄子花叶病毒
(eggplant
mosaic
virus)以及甜菜坏死黄脉病毒(beet
necrotic
yellowveinvirus)的反向遗传研究中也存在类似问题¨…。
已有研究工作表明,可以通过选择合适的载体、菌株等方法克服这一限制因素。3.1载体选择黄病毒属病毒主要包括JEV、黄热病毒(yellow
fever
virus,YFV)和登革病毒(Denguevirus,DENV)
等,基因组全长eDNA在宿主细胞中的不稳定性严重阻碍了
黄病毒反向遗传技术的研究进展。在黄病毒属病毒中,YFV是感染性克隆构建较为成功的成员之一。Rice等…1在黄热病毒两个亚基因组克隆,即pYF5’3’IV和pYFM5.2的基础上经体外连接构建了病毒全长eDNA片段,以其为模板经体外转录和转染获得了恢复病毒。黄病毒也是第一个使用体外
连接方法获得感染性转录本RNA的病毒。载体pACYCl77
是一低拷贝质粒,以该载体为骨架成功构建了鼠疫病毒感染性eDNA克隆1120”。低拷贝质粒pACNRIl80是在pACYCl77质粒的基础上改造而来的。Rice等…1以pACNRll80为载体成功获得了YF-17D的全长eDNA克隆pACNR/FLYF-17Dx。以其为模板转录出的RNA转录本经脂
质体转染后的病毒滴度可达105—106
ph/¨g
RNA。且
pACNR/FLYF.17Dx克隆来源的恢复病毒与亲本病毒具有相
似的蛋白水解动力学曲线、病毒RNA合成和生长曲线¨“。
万方数据
解决JEV全长cDNA在细菌体内的潜在毒性和不稳定性的问题,可以通过选择合适的克隆载体得以解决。通常而言,
携带外源长片段的载体会对宿主表现出一定程度的限制性,而基冈组eDNA在中、低拷贝的克隆载体中较稳定¨…。过
去各种载体系统试图用于装配JEV全长eDNA,包括大肠埃希菌的黏性末端质粒载体,结果表明cDNA克隆在遗传学上
均不稳定¨’”。“。与之类似.以高拷贝PUC质粒和中拷贝
pBR322载体为骨架构建JEVCNU/LP2全长eDNA克隆的工作也是失败的∞o。与此相比,Sang.Im等阳1将JEV
cDNA
克隆在低拷贝的BACs载体上(每个大肠埃希菌细胞中只有1或2拷贝),获得了稳定的JEV感染性cDNA克隆,在大肠
埃希菌中增殖180代后其遗传学结构和功能依然稳定。类
似的低拷贝载体在一些其他黄病毒感染性克隆构建工作中
也有报道,如蜱传脑炎病毒(tick.borne
encephalitis
virus,
TBEV)¨副和墨累溪谷脑炎病毒(murrayvalley
encephalitis
virus.MVEV)”…。这些研究均表明,选择BACs、pACNRll80质粒等低拷贝载体是黄病毒感染性全长eDNA克隆构建工作的重要策略之一,而这对于构建JEV全长eDNA克隆具有
一定的借鉴意义。
3.2其他因素除了选择合适的载体之外,宿主菌、克隆方
法的选择同样对JEV等黄病毒感染性全长eDNA克隆构建工作至关重要。研究结果表明选择生长相对较为缓慢的宿
主菌,如DH5a、JMl09及MCl061等,可以有效提高JEV基
因组eDNA的稳定性Ⅲ1。此外,选择合理的克隆方法有助于感染性克隆的构建。感染性克隆的构建方法主要有三种,
第一种方法是运用RT—PCR方法分段扩增出JEV基因组
eDNA片段,将得到的eDNA片段分段连人载体后得到全长eDNA模板用于转录"’11,tsj,这种方法规避了病毒eDNA基因组的不稳定问题,但实用性较筹,较为繁琐费时。第二种方法是利用高保真长片段RT-PCR法获得含有SP6或17启
动子的全长eDNA,这种方法虽然简便快捷,但对试剂品质
要求较高,而且难以对病毒基因组进行定点突变旧“。第三种则是在选择合适的载体和宿主菌的前提下运用融合PCR法分段获得JEV基因组eDNA片段。然后经体外连接得到JEV基因组全长eDNA后将全长eDNA连入载体中的方法。4乙脑病毒反向遗传技术的应用
4.1基础研究反向遗传技术是研究RNA病毒基因组结构和功能之间关系的新兴技术。JEV反向遗传技术可被广泛应用于基础理论研究和实践生产研究领域。在基础研究方面,反向遗传技术可以帮助我们研究JEV复制、转录及转
染的分子机制,也可以确定JEV神经毒力和发病机制相关的毒力位点。Sang.1m等¨’利用反向遗传技术对JEV的3’末端进行了研究,研究表明具有3’末端保守序列的RNA转
录本的感染性比经过反向遗传技术改造后的3’末端具有3
或4个与病毒核苷酸序列无关的RNA转录本要高lO倍。
刘欣玉等旧引利用反向遗传技术对JEVSA4及SAl4的神经
毒力进行了研究,SA4的氨基酸序列与SAl4存在17个位点
的差异。而SA4的神经毒力比SAl4强,说明了这17个差异
氨基酸位点口r能影响着JEV的神经毒力。而JEV免疫逃逸、跨越血脑屏障及其跨种问传播与感染等分子机制的进一
步探索也离不开JEV反向遗传技术平台。
4.2载体开发通过反向遗传技术可以将JEV感染性克隆改造成RNA型或DNA型的复制子载体,这些载体在真核细胞乍物学研究巾广泛应用.是表达外源基因极有价值的遗传
学丁具。作为RNA型病毒载体,外源基冈在体内有效表达
的载体系统是研究基因治疗和疫苗的重要策略,日前常用DNA病毒载体、逆转录病毒载体或裸DNA,而RNA病毒载
体的应用则提供r另一种研究途径。与常用的DNA病毒载
体相比,RNA病毒载体的基闪组小,构建和操作较为方便,其生命周期中不经历DNA阶段,不会整合到宿主细胞染色体从而引起低水平表达或基因沉默,不会改变物种的遗传性。Sang—lm等【61将两个代表性的报告基因绿色荧光蛋白
(greenfluorescentprotein,GFP)和荧光索酶(1ucifecase)插入
JEV基因组RNA后转染BHK-2l细胞,两个报告基因均得到
了表达。由此可知,JEV感染性eDNA在表达外源基因时起
到了真核表达载体的作用。
4.3重组疫苗研发减毒己脑重组疫苗是经过定向操纵感染性JEVeDNA克隆,从而产生孽组JEV。如JEV的E蛋白中的1个氨肇酸就是这样被证实为毒力相关位点,当JEV的E—138位点谷氨腋突变为赖氨酸时,突变株的毒力比原毒株减弱¨…。嵌合疫苗是在JEV基因组感染性克隆基础卜,将不同病毒抗原基因嵌合在一起,使之在体内产生有感染性的病毒粒子。因此,反向遗传技术为JEV的相关研究提供了有利的生物学工具。
总之,反向遗传技术是研究病毒分子机制和遗传学原理的技术平台,本综述概述了JEV反向遗传技术的研究状况、限制因素及其在基础研究等领域巾的应用。如何构建稳定的全长eDNA仍是JEV反向遗传技术尚待解决的核心问题。尽管JEV感染性RNA可以通过全长cDNA克隆获得,但是当eDNA克隆在宿主细胞中复制时容易引入突变。而体外连接获得的全长eDNA模板在遗传学七具有稳定性,但是体外连接方法费时、费力,实际应用价值不大。已有研究丁作表明,选用BACs、pACNRll80质粒等中低拷D!载体是解决黄病毒全长eDNA在细荫体内潜在毒性和不稳定性的重要策略之一。而这对于构建JEV感染性全长eDNA克隆具有一定的借鉴意义。
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