单核苷酸多态性与结直肠癌风险的关系

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!"##$单核苷酸多态性与结直肠癌风险的关系

金明娟"陈坤"张扬"张薇"刘冰"张勇晶!基础研究!

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浙江大学医学院公共卫生学院

流行病与卫生统计学教研室"

浙江杭州48119:

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通讯作者!陈坤

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基金项目!国家自然科学基金

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收稿日期!0113E19E07

修回日期!0113E17E19";>/?";#?#>;#@DE#?FGE!9(:*;:4>=8?*44I=%>%8&:4%&’@4>A:*&DH:4*J:4=8?H%&*A%8&:4?>8F9C++B*FF4=AAM4F)&=A%8&8FAM4)>=4KLM%>4D=*>4(=8&A:8@>A)D;N*>A84I*?%&4AM4=8::4@*A%8&>8FAM4O?8>A=8??8&>%&’@4&)=@48A%D4?>"P#Q>$8F9C++B’4&4!+RSOTUL!1RVUSS0*&D1RWBXR0!A8:%>J8F=8@8:4=A*@=*&=4:KHE?IA:/!9C++B’4&8A;%&RTV=8@8:4=A*@=*&=4:*&DSRB?*A=M4DM4*@AM;=8&A:8@>N4:4*&*@;Y4DH;4=M*%&:4*=A%8&(:4>A:%=A%Z4F:*’?4&A@4&’AM?%Q+C(C[5Q$KLM4*D\)>A4D8DD>:*A%8"]C$*&D^X_=8&F%D4&=4%&A4:Z*@"+"$N4:4=*@=)@*A4D)>%&’)&=8&D%A%8&*@@8’%>A%=:4’:4>>%8&?8D4@A84Z*@)*A4AM4=8::4@*A%8&>8FAM4O’4&8A;A8:%>J8F=8@8:4=A*@=*&=4:KLM4M*A:%H)A%8&N*>4>A%?*A4DH;-,@%&J*’4>8FAN*:4BKRK"E/BJ?/!LM4:4N*>&8>%’&%F%=*&AD%FF4:4&=4>%&>4@4=A4D=M*:*=A4:%>A%=>!>)=M*>*’4!>4I!H8D;?*>>%&D4I!=%’*:4AA4(>?8J%&’*&D*@=8M8@(D:%&J%&’>A*A)>!H4AN44&AM4*&DAM4=8&A:8@>KLM4F:4E)4&=%4>8F?)A*&ARSOTUL!RVUSS0!*&DRWBXR0*@@4@4>N4:4R^K^X_!BBKRR_!*&DRWKRR_!:4>!*&DORKWV_!BRKOU_!*&DRVKRV_!:4>&AM4:4N*>*@>8&8>%’&%F%=*&AD%FF4:4&=4H4AN44&AM4R’:8)K0@@AM4?4AAM4,*:D;(34%&H4:’4E)%@%H:%)?K#8>%’&%F%=*&A=8::4@*A%8&8F9C++B+RSOTUL!1RVUSS0!*&D1RWBXR0?>A8:%>J8F=8@8:4=A*@=*&=4:N*>F8)&DK->A%?*A4DH;-,@%&J*’4>8FAN*:4BKR!’4&4A%=@%&J*’4D%>4E)%@%H:%)?4I%>A4DH8AM%&AM4*&DAM4=8&A:8@>!*&D+11!+10!+01!*&DL11N4:4AM4U?8>A=8??8&M*K,8N4Z4:!AM4:4N*>&8>%’&%F%=*&AD%FF4:4&=4%&M*A:%H)A%8&H4AN44&AM4R’:8)%^XKXU_Z>K^SKSU_!!‘TKTX$K#A1#JB/FA1/!"&,*&8)AM4:&+M%&*!9C++B+RSOTUL!1RVUSS0!*&D1RWBXR0?>M*Z4&8=8::4@*A%8&>A8:%>J8F=8@8:4=A*@=*&=4:K,8N4Z4:!AM4’4&4A%=@%&J*’4D%>4E)%@%H:%)?4I%>A>%&AM4>4O%A4>!*&D+11!+10!+01!*&DL11*:4AM4U?8>A=8??8&M*K@EKLA":/’+8@8:4=A*@&48?&G#0:4>=8??$摘要%背景与目的!S线交叉互补基因8%SE*+T*%;+#*/*(&&/(F;,%F%$=#$PP*();8!SM!!8$编码蛋白在U@V单链断裂修复和U@V碱基修复过程中起重要作用(该基因外显子多态性的存在可影响编码蛋白的功能活性!最终使机体对癌症的易感性发生变化(本研究旨在探讨该基因外显子最常见的4处单核苷酸多态%&#$P,%$)/,%(=#

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!"#金明娟!等I

!"#!和限制性片段长度多态性"$%&’$()’(*%+$,-.%/’0%/-’1+++R7:=8>?$@79>::A和@7B;C7A#这些突变位点2304.3$21(&.##56!!分析方法#检测789例结直肠癌病例和的存在会影响编码蛋白的功能活性#最终使机体对:7;例成组匹配的正常对照?$@79>::A和

@7B;C7A基因型#并比较不同基因型与结直肠癌风险的关肿瘤的遗传易感性发生变化%有关上述GX!与结直

系%采用DE6(/F,-%G3+’H,$%;I7统计分析软件对研究对象肠癌风险的相关性#仅有少量的文献报道%本研究的单体型分布进行预测%结果!年龄$性别$身体质量指数以全国结直肠癌高发县+++浙江省嘉善县为研究"J3K4.,&&(/K%L#MNO!等个体特征#以及吸烟$饮酒等常见现场#进行自然人群为基础的

测分型发现#结直肠癌病例组携带7:=8>?$79>::A和

7B;C7A变异等位基因的频率分别为7SISCT$;;I77T和!材料与方法

7BI77T#对照组分别为=7IB9T$;7I=>T和79I79T#各多态等

位基因在两组间分布均没有显著性差异"!Q8I8C!%各多态基!"!研究对象

因型分布经!7拟合优度检验均符合E,$K4UV%(/J%$-平衡定所有研究对象均来自;SBS年C月至;SS8年律#且在两组间都没有显著性差异"!Q8I8C!%没有观察到各>月在浙江省嘉善县建立的结直肠癌自然人群随多态基因型与结直肠癌发病风险存在显著相关关系"!Q访队列)C*%789例结直肠癌病例为队列内;SS8年C8I8C!%单体型分析发现#各变异等位基因在病例组和对照组月至788>年;7月期间发现的结直肠癌病例#其内均存在遗传连锁不平衡现象#R@@$R@A$RA@和?@@是中;7:例结直肠癌病例来自于7887年C月在当最常见的>类单体型#其在两组的分布频率总和分别为地开展的现场病例对照研究):*%另自7887年C月SCIC>T和S:I:>T#然而在两组间同样不存在显著性差异"!Q

8I8C!%结论!我国浙江省嘉善县人群中#?$起#对该队列人群进行随访监测#如有新病例报告

@79>::A和@7B;C7A基因多态性与结直肠癌发病风险不存即将其纳入%对照选取以年龄和性别为成组匹配在相关性#然而各变异等位基因存在遗传连锁不平衡现象#因素#以;_=比例从目的人群选取正常对照":7;R@@$R@A$RA@和?@@是最常见的>类单体型%例!#如有多个个体符合对照要求#则以单纯随机关键词!结直肠肿瘤&WXA修复基因&:9Y8:由统一培训的调查员上门进行问卷调查%

!"#标本采集及基因组$%&提取

788>年#卫生部颁发的’中国癌症预防与控制经研究对象知情同意后#采集每一个体静脉规划纲要"788>Z78;8!(指出#结直肠癌$肺癌及乳血C.0#取其中7.0装入带有8I7.0枸橼酸钠的腺癌等在我国的发病率迅速上升#与肝癌$食管真空小试管#另=.0装入无抗凝剂的真空试管#现癌$胃癌$宫颈癌和鼻咽癌并列为我国目前重点防场登记姓名和编号#当天送回当地肿瘤所#统一放治的B大恶性肿瘤#这B种恶性肿瘤死亡人数约入Y78‘冰箱保存%储存样品于;周内送回浙江大占恶性肿瘤总死亡人数的B8T以上);*%研究表明#学医学院#取枸橼酸钠抗凝血;.0#以盐析法抽提多于S8T结直肠癌的发生是环境因素与遗传因素全血细胞基因组WXA后#于Y:8‘冰箱储存待检%交互作用的结果)7*%!"’()**!基因分型

?$@7B;C7A和@79>::A各多)3.20%.%/’(/--$3[2;#?和@7B;C7AGX!&分型因子包括离子化放射$氧应激等作用最常见的受根据文献)9*报道#采用多重!R#同时扩增目的片损形式)=#>*%G1%/等)>*报道了该基因=处常见的单段%!R#反应体系78$0"含,;8..30P6?$(&UER0#核苷酸多态"&(/-0%/[)0%3’(K%2304.3$21(&.#GX!!C8..30P6aR0#7I8..30P6N-R07#8I7..30P6

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,01,1/).!各*45!6789:"*4;?1聚合

酶"以及?1模板&B&C反应条件

为$D+E预变性

;’E延伸36F@"进行)-个循环后";’E最后延伸

;6F@&B&C产物#&’G)*+,+D3HI和0’23-’1

G3-HI!与限制性内切酶$%&"于);E温育GJ"

经含溴乙锭的5K琼脂糖凝胶电泳分离后于

BL1CM1&N1荧光成像仪下观察结果&5G)*+&野图3B&\/$%&"酶切的b\&&3&5GS*+,和0523-51]?B生型等位基因有5个限制性酶切位点"消化后产联合分型电泳图

生5D)’3;2和5*HI产物"而5G)*+#变异等位基cFAdUX3b/UTVUXITFUZU7%%Z76I8X6X@YF@AAU7dI3因仅有3个酶切位点"消化后产生)3)HI和3;2#b\&&3!AX@7YVIX%&5GS*+,T@!0523-51T@T8VeX!HVHI产物%523-50野生型等位基因有3个限制性酶I78V6XUT%XZJTF@UXTZYF7@/UX%YUFZYFfX^UTA6X@Y8X@AYJ

I78V67UIJF%6#B&C/Cc:B!_FYJ$%&"!FAX%YF7@切位点"消化后产生);-HI和5+*HI产物"而:T@X%3"RT@!G$&&_F8!AX@7YVIX^7U&5GS*R,T@!00_F8!YVIX

523-51变异等位基因酶切位点消失#图3!&^7U0523-51%8T@X5$&,JXYXU7eVA7d%AX@7YVIX^7U&5GS*R,T@!05;+GG1O?B参照文献(2)并纠正其引物序列中501JXYXU7eVA7d%YVIX^7U0523-51%8T@XS$,,6dYT@YJ767eVA7d%个错误碱基"上游引物-P/&&10,00,0&,1AX@7YVIX^7U&5GS*R,T@!00_F8!YVIX^7U0523-51%8T@X-$&&1&&,11,&/)."下游引物-./&1&,&10&1&&1_F8!AX@7YVIX^7U&5GS*R,T@!01JXYXU7eVA7d%YVIX^7U0523-51%

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聚合酶"余同前&B&C反应条件为$DRE预变性

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5*3HI与限制性内切酶’%""于S;E温育GJ后"

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生等位基因有3个(%""酶切位点"消化后产生

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切位点消失#图5!&实验所需引物和试剂均从上海

生工生物工程技术服务有限公司处合成和购买&

!"#统计学分析方法

以#5检验比较性别’各基因型等分类变量在

结直肠癌病例组与对照组之间分布的差异"以成图5B&C/(%""酶切的b\&&305;+GG1]?B分型电泳图组)检验比较组间年龄的差异%采用#5拟合优度cFAdUX5b\&&305;+GG1T@T8VeX!HVB&\/\c:B_FYJ检验明确各变异基因型在对照组分布是否符合(%""!FAX%YF7@

LTU!V/WXF@HXUA#L/W!遗传平衡定律%采用非条件:T@X%3/+T@!G$00_F8!AX@7YVIX^7U05;+GG1%8T@X-$01:7AF%YFZ回归模型计算比值比#[\!及其D-K可信JXYXU7eVA7d%AX@7YVIX^7U05;+GG1%8T@XM$3**HI>?16TUaXUQ区间#&N!表示各基因型’联合基因型与结直肠癌

风险的关联性%以上统计分析均在]B]]3’Q*^7U

WF@!7_%中进行&同时采用‘L:F@aTAX]7^Y_TUX$结果

3Q5软件对结直肠癌病例组和对照组单体型分布$"!研究对象基本特征

进行预测&病例组与对照组相比"两组患者在年龄’性

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!""金明娟!等(4566%单核苷酸多态性与结直肠癌风险的关系

别!!"#等个体特征"以及吸烟!饮酒等常见环境锁不平衡现象"6II(6I3(63I和0II是最常见暴露因素的分布和$或构成比上差异均无显著性的/类单体型"上述/种单体型在病例组和对照组#表%$%表%中吸烟史定义为&每天吸烟%支以上"的分布频率总和分别为7-(-/8和7+(+/8"均大于且持续%年以上’"饮酒史则定义为&每天饮酒%7-8%然而"两组对象单体型分布差异也无显著性次以上"且持续&个月以上’%其中年龄(性别为本)!9)()-$%

研究的匹配因素"两组研究对象的性别构成基本

一致)!’%())$"年龄分布均衡)!’)(&*$"病例组的表"结直肠癌患者和对照人群等位基因和单体型分布中位年龄为+,岁"对照组为+-岁%&’()*"&/*30*:;*4.86-,10-(;1-2423>!>"%?#@&"

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表!"#$例结直肠癌患者和%"!例正常5’1-*41,’461/*.24102),+.’,*,)9$,

对照人群的基本特征MFBV6D>FHDPR^@F=B>FR!Y@PWB

&’()*!+’,-../’0’.1*0-,1-.,231/*"#$.2)20*.1’).’4.*03PPBPBR@

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!"’#$%%&单核苷酸多态基因型分布与结直肠

!"!#$%%&单核苷酸多态等位基因及单体型分癌风险的相关性

布对照组携带*+&)/66(60和00基因型的频率

对.*+&)/0和1*2%-*3位点基因型检测分分别为/+(%)8(/*()-8和%%(2-8"携带*,/++II(型"分别有-例病例和-例对照样本未能成功扩I3和33基因型的频率分别为,+(/+8(**(/)8和增"对1*,/++3位点基因型检测分型"分别有*例%(%/8"携带*2%-*II(I3和33基因型的频率分病例和-例对照样本未能成功扩增%4566%单核别为-/(,%8(&+()/8和7(*-8*而病例组分别为苷酸多态等位基因及单体型分布见表*%结直肠癌-)(778(&2(%*8和%)(278",7()*8(%7(-%8和病例组携带*+&)/0(*,/++3和*2%-*3变异等位%(/+8"-&(7+8(&-(+/8和%)(/)8%基因型分布仅基因频率分别为*7(7-8(%%(**8和*2(**8"对照I*2%-3在对照组分布没有符合;JK遗传平衡定组分别为&*(2,8(%*(&/8和*,(*,8"各等位基因律"但在两组间均无显著性差异)!9)()-$%经年在两组间分布差异均无显著性)!9)()-$%病例组龄(性别(L"M(吸烟和饮酒状况等多因素校正"没和对照组4566%基因单体型分布频率和个体数有观察到45..%各多态基因型与结直肠癌风险存通过:;?@ABCDEFG@HB%(*软件进行预测"两组在显著相关关系)!9)()-$)表&$%以野生型联合对象等位基因分布经似然比!*检验均存在遗传连)..JIIJII$为对照组"分析各多态基因型联合与

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金明娟!等M)*++,单核苷酸多态性与结直肠癌风险的关系

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结直肠癌易感性的相关关系!同样经以上因素校发生和促进其进展%)*++,基因编码蛋白本身没正!均没有观察到显著的相关关系"!!"#"$#"表%$%有催化活性!可通过与-(*-&(-.,&多聚核苷酸

激酶/磷酸酶&&’(连接酶!及&’(多聚酶"结

表!"#$$%各多态基因型的分布及与结直肠癌风险的合在&’(单链断裂修复和&’(碱基修复过程起

关系重要作用%)*++,基因0处最常见的单核苷酸多

&’()*!&+*,-*./*0123456-4(/64707,"8$$%$9:;9?=@@A!’03>9B%C9AD*0762E*5’036+*4-17--*)’64705的编码氨基酸发生变化((78,9%37:&(7816";

67-45F7,17)7-*16’)1’01*-)1’5*5"G$*(780994>?#!从而影响)*++,蛋白的功能活性!如4F?BPQ:FR+B?P7B>=-RP

+120"%3++16%"%2M,"$,"0"$"M99$,M"""*FGM$(780994>?变异可导致个体碱基切除修复能力降

+31$9"%1M"$$55"06M,1$,M0"""M50U1M01$"M06低!从而导致遗传学损伤水平增高!最终使机体对!!!!3350",,M6$$11","M69$,M""""M$5U,M55$,M""癌症的易感性发生变化)%!9*%

+3S33001"$0M9"$99"%9M",$"M55""M$$U,M"6$"M,0对1"5例结直肠癌病例和21,例正常对照415%22(44%5,"52M%2$,21"59M"1$,M"""*FGM$)*++,单核苷酸多态检测分型发现!结直肠癌病

4(,06"11M%"$%"",9M$,$"M95""M1%U0M9,$"M92

((5",M,%$0",M%2$"M5%""M,6U0M"5$"M26例组携带120"%3&15%22(和16,$1(变异等位基

4(S((,%$"10M$%$%0"1"M96$"M56""M$1U,M,6$"M1%因的频率分别为19#9$@&,,A11@和16#11@!对照416,$1(44005"$%M5,$,"9"$0M92$,M"""*FGM$组分别为01#65@&,1#0%@和15#15@!等位基因分

!!!!!4(111"02M"%$51"0$M2%$,M"6""M$9U,M92$"M6"布在两组间差异均无显著性"!!"#"$$%对照组即

(($5"9M1$$1,","M%"$,M"%""M$6U,M66$"M69正常人群各变异等位基因分布频率与现有对中国4(S((159"%$M19$90"%2M"%$"M9$""M26U,M0%$"M56汉族人群研究报道),"!,,*基本一致!与;B?8等),1*在R3EFVRPRBG)*++,+120"%3!415%22(!R?V416,$1(8F?BPQ:F=韩国人中开展的研究报道频率也基本一致%也进R7FW?RXRRT>F=R?V$!1!$:RP

7F=:FYPQMT(VZW=PFVTQR8F!=F[!TBVQ\R==

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有关)*++,基因单核苷酸多态与结直肠癌风

表="8$$%联合基因型的分布及与结直肠癌风险的关系险的相关性!现仅有少数文献报道!结果也不一

&’()*=&+*,-*./*0123456-4(/64707,"8$$%致%DEF7

-45F7,17)7-*16’)1’01*-%6例$首次报道了)*++,单)1’5*5(G$*核苷酸多态性与结直肠癌的相关性!研究认为

+B\T=-RP

(120"%]15%22]16,$1$R120"%3和16,$1(变异等位基因可增加早发性结

++]44]442$(,"M2%$19(,%M02$,M""(*FGM$直肠癌"C%"岁$的罹患风险%;B?8等),1*在韩国人++]44]4(S((,01(1,M2"$%6(10M52$"M61("M%5U,M%1$"M%6中开展的,H,病例对照研究"各1"9例$认为!++]4(S((]44%5(5M29$,2(5M91$"M5$("M05U,M$$$"M%%16,$1(变异等位基因与结直肠癌风险的增高显著++]4(S((]4(S((09(2M06$,"(%M9$$"M$6("M1$U,M01$"M,9

+3S33]44]44,51(16M,$$$,(1$M1$$"M2%("M05U,M,,$"M,,相关"I*+,#2,!9$J+K+,A"9L1M09$!对120"%3&

+3S33]44]4(S((,""(,2M05$01(,$M6%$"M50("M%"U,M01$"M1915%22(和16,$1(联合单体型的预测和分析认+3S33]4(S((]44%9(6M"1$,0(2M%%$"M$%("M1$U,M,5$"M,1为!单体型分布在病例组和对照组均存在遗传连+3S33]4(S((]4(S((5(,M,$$0(,M%9$"M5%("M,%U0M9,$"M51锁不平衡现象!仅存在+44&+4(&+(4和344%R3EFVRPRBG,"YB?P7B>=R?V$:RPRT>FM类单体型!并且单体型分布在病例和对照组间存T(VZW=PFVTQR8F!=F[!TBVQ\R==

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关关系"I*+,M$9!9$O+K+,#",L1#$9$%本研究采

外环境化学致癌物和离子辐射等物理因素作用,H0配对的病例对照研究方法!在浙江省嘉善县用于机体导致的&’(碱基损伤和&’(链断裂!,969年建立的结直肠癌自然人群随访队列中开展是组织细胞癌变的重要分子事件!可诱发癌症的了)*++,基因单核苷酸多态与结直肠癌风险的

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!"#金明娟!等0GH@@_单核苷酸多态性与结直肠癌风险的关系

相关性研究!对!"#$%&"’(%"")和*+,-*)#处单R=?75V9V&J’0EQ=7=H9R#’///#%-B$,%(,K,+0核苷酸多态基因定型分析发现#单个变异基因型&%’:O95EH#J;59RFE#E;O?95>94R9?20Z;5P;5R9?T7=4T9与结直肠癌风险不存在显著相关关系$!./0/-%!7U45;7P4VRQWR=4=Q=4;5T7?475=R9^4R=7=\;MYU;?\O4P对变异基因型的联合分析同样也没有观察到显著

@75P9?H9R#_BB+#-+$%%("$%K"$+0

相关关系$!./0/-%!同时#研究通过单体型分析软&-’@O95‘#@74J#34QGa#9=7M0Z9R=9VP7R9bP;5=?;MR=QVY;5件123456789:;7?9,0!对两组对象的单体型=O9?4R6

P75P9?75V?9P=7MP75P9?&J’0@75P9?L9=9PN?9T#!$$-#!B

型#其在两组对象内的分布频率总和均大于B-C#$!%(_%"K_-%0与2;58等&,!’研究结果基本一致!然而单体型分布&(’:O9?47?945VQP9V45OQU75MYU\O;PY=9RWY=O9=;W7PP;bR\9P4

&+’DQ=649>4PeL#HQR45E#159>;MV3#9=7M0A959=4P

上进行了估计#没有对每个个体单体型的真实分\;MYU;?\O4RUR45LZ)?9\74?8959R75V?4R6;

综上所述#在浙江省嘉善县开展的以自然人&_$’宋春英#谭文#林东昕0中国人LZ)修复基因GH@@_

单核苷酸多态及其与食管癌风险的关系&J’0癌症#!$$_#

群为基础的病例对照研究表明#GH@@,@’"#/%&"!$$_%(!+K[_0A’(%"")和A’+,-’)单核苷酸多态与结直肠癌的&__’H7=57R458O9L#a7;:G#&758?97J)#9=7M0N;MYU;?\O4RUR发病风险没有相关关系!对单体型的分析发现#;

GH@@_8959#7MP;O;MP;5RQU\=4;575VP;M;?9P=7MP75P9?&J’0

最常见的%类单体型!F5=J@75P9?#!$$-#__"$[%(%!+K%[!0

&_[’:=9?5E@#XUW7POLE#A4MR@2#9=7M0LZ)?9\74?8959

!参考文献"GH@@_\;MYU;?\O4RUR#RU;6458#75VWM7VV9?P75P9??4R6

&_’中华人民共和国卫生部0中国癌症预防与控制规划纲要&J’0@75P9?1\4V9U4;MD4;U7?69?RN?9T#!$$_#_$$!%(_!-K

’//%I!/,/&J’0中国肿瘤#*//%#,#$,%("-K"+0_[_0&!’L;MMH#N9=;H0&O9P7QR9R;

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!癌症"!"#$%&%’()*$+,(-.+$/%*#0112#03$4%&0256027!"#

!"##$单核苷酸多态性与结直肠癌风险的关系

金明娟"陈坤"张扬"张薇"刘冰"张勇晶!基础研究!

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浙江大学医学院公共卫生学院

流行病与卫生统计学教研室"

浙江杭州48119:

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通讯作者!陈坤

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基金项目!国家自然科学基金

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收稿日期!0113E19E07

修回日期!0113E17E19";>/?";#?#>;#@DE#?FGE!9(:*;:4>=8?*44I=%>%8&:4%&’@4>A:*&DH:4*J:4=8?H%&*A%8&:4?>8F9C++B*FF4=AAM4F)&=A%8&8FAM4)>=4KLM%>4D=*>4(=8&A:8@>A)D;N*>A84I*?%&4AM4=8::4@*A%8&>8FAM4O?8>A=8??8&>%&’@4&)=@48A%D4?>"P#Q>$8F9C++B’4&4!+RSOTUL!1RVUSS0*&D1RWBXR0!A8:%>J8F=8@8:4=A*@=*&=4:KHE?IA:/!9C++B’4&8A;%&RTV=8@8:4=A*@=*&=4:*&DSRB?*A=M4DM4*@AM;=8&A:8@>N4:4*&*@;Y4DH;4=M*%&:4*=A%8&(:4>A:%=A%Z4F:*’?4&A@4&’AM?%Q+C(C[5Q$KLM4*D\)>A4D8DD>:*A%8"]C$*&D^X_=8&F%D4&=4%&A4:Z*@"+"$N4:4=*@=)@*A4D)>%&’)&=8&D%A%8&*@@8’%>A%=:4’:4>>%8&?8D4@A84Z*@)*A4AM4=8::4@*A%8&>8FAM4O’4&8A;A8:%>J8F=8@8:4=A*@=*&=4:KLM4M*A:%H)A%8&N*>4>A%?*A4DH;-,@%&J*’4>8FAN*:4BKRK"E/BJ?/!LM4:4N*>&8>%’&%F%=*&AD%FF4:4&=4>%&>4@4=A4D=M*:*=A4:%>A%=>!>)=M*>*’4!>4I!H8D;?*>>%&D4I!=%’*:4AA4(>?8J%&’*&D*@=8M8@(D:%&J%&’>A*A)>!H4AN44&AM4*&DAM4=8&A:8@>KLM4F:4E)4&=%4>8F?)A*&ARSOTUL!RVUSS0!*&DRWBXR0*@@4@4>N4:4R^K^X_!BBKRR_!*&DRWKRR_!:4>!*&DORKWV_!BRKOU_!*&DRVKRV_!:4>&AM4:4N*>*@>8&8>%’&%F%=*&AD%FF4:4&=4H4AN44&AM4R’:8)K0@@AM4?4AAM4,*:D;(34%&H4:’4E)%@%H:%)?K#8>%’&%F%=*&A=8::4@*A%8&8F9C++B+RSOTUL!1RVUSS0!*&D1RWBXR0?>A8:%>J8F=8@8:4=A*@=*&=4:N*>F8)&DK->A%?*A4DH;-,@%&J*’4>8FAN*:4BKR!’4&4A%=@%&J*’4D%>4E)%@%H:%)?4I%>A4DH8AM%&AM4*&DAM4=8&A:8@>!*&D+11!+10!+01!*&DL11N4:4AM4U?8>A=8??8&M*K,8N4Z4:!AM4:4N*>&8>%’&%F%=*&AD%FF4:4&=4%&M*A:%H)A%8&H4AN44&AM4R’:8)%^XKXU_Z>K^SKSU_!!‘TKTX$K#A1#JB/FA1/!"&,*&8)AM4:&+M%&*!9C++B+RSOTUL!1RVUSS0!*&D1RWBXR0?>M*Z4&8=8::4@*A%8&>A8:%>J8F=8@8:4=A*@=*&=4:K,8N4Z4:!AM4’4&4A%=@%&J*’4D%>4E)%@%H:%)?4I%>A>%&AM4>4O%A4>!*&D+11!+10!+01!*&DL11*:4AM4U?8>A=8??8&M*K@EKLA":/’+8@8:4=A*@&48?&G#0:4>=8??$摘要%背景与目的!S线交叉互补基因8%SE*+T*%;+#*/*(&&/(F;,%F%$=#$PP*();8!SM!!8$编码蛋白在U@V单链断裂修复和U@V碱基修复过程中起重要作用(该基因外显子多态性的存在可影响编码蛋白的功能活性!最终使机体对癌症的易感性发生变化(本研究旨在探讨该基因外显子最常见的4处单核苷酸多态%&#$P,%$)/,%(=#

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!"#金明娟!等I

!"#!和限制性片段长度多态性"$%&’$()’(*%+$,-.%/’0%/-’1+++R7:=8>?$@79>::A和@7B;C7A#这些突变位点2304.3$21(&.##56!!分析方法#检测789例结直肠癌病例和的存在会影响编码蛋白的功能活性#最终使机体对:7;例成组匹配的正常对照?$@79>::A和

@7B;C7A基因型#并比较不同基因型与结直肠癌风险的关肿瘤的遗传易感性发生变化%有关上述GX!与结直

系%采用DE6(/F,-%G3+’H,$%;I7统计分析软件对研究对象肠癌风险的相关性#仅有少量的文献报道%本研究的单体型分布进行预测%结果!年龄$性别$身体质量指数以全国结直肠癌高发县+++浙江省嘉善县为研究"J3K4.,&&(/K%L#MNO!等个体特征#以及吸烟$饮酒等常见现场#进行自然人群为基础的

测分型发现#结直肠癌病例组携带7:=8>?$79>::A和

7B;C7A变异等位基因的频率分别为7SISCT$;;I77T和!材料与方法

7BI77T#对照组分别为=7IB9T$;7I=>T和79I79T#各多态等

位基因在两组间分布均没有显著性差异"!Q8I8C!%各多态基!"!研究对象

因型分布经!7拟合优度检验均符合E,$K4UV%(/J%$-平衡定所有研究对象均来自;SBS年C月至;SS8年律#且在两组间都没有显著性差异"!Q8I8C!%没有观察到各>月在浙江省嘉善县建立的结直肠癌自然人群随多态基因型与结直肠癌发病风险存在显著相关关系"!Q访队列)C*%789例结直肠癌病例为队列内;SS8年C8I8C!%单体型分析发现#各变异等位基因在病例组和对照组月至788>年;7月期间发现的结直肠癌病例#其内均存在遗传连锁不平衡现象#R@@$R@A$RA@和?@@是中;7:例结直肠癌病例来自于7887年C月在当最常见的>类单体型#其在两组的分布频率总和分别为地开展的现场病例对照研究):*%另自7887年C月SCIC>T和S:I:>T#然而在两组间同样不存在显著性差异"!Q

8I8C!%结论!我国浙江省嘉善县人群中#?$起#对该队列人群进行随访监测#如有新病例报告

@79>::A和@7B;C7A基因多态性与结直肠癌发病风险不存即将其纳入%对照选取以年龄和性别为成组匹配在相关性#然而各变异等位基因存在遗传连锁不平衡现象#因素#以;_=比例从目的人群选取正常对照":7;R@@$R@A$RA@和?@@是最常见的>类单体型%例!#如有多个个体符合对照要求#则以单纯随机关键词!结直肠肿瘤&WXA修复基因&:9Y8:由统一培训的调查员上门进行问卷调查%

!"#标本采集及基因组$%&提取

788>年#卫生部颁发的’中国癌症预防与控制经研究对象知情同意后#采集每一个体静脉规划纲要"788>Z78;8!(指出#结直肠癌$肺癌及乳血C.0#取其中7.0装入带有8I7.0枸橼酸钠的腺癌等在我国的发病率迅速上升#与肝癌$食管真空小试管#另=.0装入无抗凝剂的真空试管#现癌$胃癌$宫颈癌和鼻咽癌并列为我国目前重点防场登记姓名和编号#当天送回当地肿瘤所#统一放治的B大恶性肿瘤#这B种恶性肿瘤死亡人数约入Y78‘冰箱保存%储存样品于;周内送回浙江大占恶性肿瘤总死亡人数的B8T以上);*%研究表明#学医学院#取枸橼酸钠抗凝血;.0#以盐析法抽提多于S8T结直肠癌的发生是环境因素与遗传因素全血细胞基因组WXA后#于Y:8‘冰箱储存待检%交互作用的结果)7*%!"’()**!基因分型

?$@7B;C7A和@79>::A各多)3.20%.%/’(/--$3[2;#?和@7B;C7AGX!&分型因子包括离子化放射$氧应激等作用最常见的受根据文献)9*报道#采用多重!R#同时扩增目的片损形式)=#>*%G1%/等)>*报道了该基因=处常见的单段%!R#反应体系78$0"含,;8..30P6?$(&UER0#核苷酸多态"&(/-0%/[)0%3’(K%2304.3$21(&.#GX!!C8..30P6aR0#7I8..30P6N-R07#8I7..30P6

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金明娟!等QbC&&3单核苷酸多态性与结直肠癌风险的关系

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!"#$%!"引物#&’()*+,上游$-./0&&&&0,&&

&100,1/)."下游$-./10&&&&1101&&&,,

,&1&,/).%0’23-’1上游$-./,,0,0&,,,&,&

,0,0,&&1/)."下游$-./,&&,&&10&&,,,,&

,01,1/).!各*45!6789:"*4;?1聚合

酶"以及?1模板&B&C反应条件

为$D+E预变性

;’E延伸36F@"进行)-个循环后";’E最后延伸

;6F@&B&C产物#&’G)*+,+D3HI和0’23-’1

G3-HI!与限制性内切酶$%&"于);E温育GJ"

经含溴乙锭的5K琼脂糖凝胶电泳分离后于

BL1CM1&N1荧光成像仪下观察结果&5G)*+&野图3B&\/$%&"酶切的b\&&3&5GS*+,和0523-51]?B生型等位基因有5个限制性酶切位点"消化后产联合分型电泳图

生5D)’3;2和5*HI产物"而5G)*+#变异等位基cFAdUX3b/UTVUXITFUZU7%%Z76I8X6X@YF@AAU7dI3因仅有3个酶切位点"消化后产生)3)HI和3;2#b\&&3!AX@7YVIX%&5GS*+,T@!0523-51T@T8VeX!HVHI产物%523-50野生型等位基因有3个限制性酶I78V6XUT%XZJTF@UXTZYF7@/UX%YUFZYFfX^UTA6X@Y8X@AYJ

I78V67UIJF%6#B&C/Cc:B!_FYJ$%&"!FAX%YF7@切位点"消化后产生);-HI和5+*HI产物"而:T@X%3"RT@!G$&&_F8!AX@7YVIX^7U&5GS*R,T@!00_F8!YVIX

523-51变异等位基因酶切位点消失#图3!&^7U0523-51%8T@X5$&,JXYXU7eVA7d%AX@7YVIX^7U&5GS*R,T@!05;+GG1O?B参照文献(2)并纠正其引物序列中501JXYXU7eVA7d%YVIX^7U0523-51%8T@XS$,,6dYT@YJ767eVA7d%个错误碱基"上游引物-P/&&10,00,0&,1AX@7YVIX^7U&5GS*R,T@!00_F8!YVIX^7U0523-51%8T@X-$&&1&&,11,&/)."下游引物-./&1&,&10&1&&1_F8!AX@7YVIX^7U&5GS*R,T@!01JXYXU7eVA7d%YVIX^7U0523-51%

8T@XM$3**HI>?1

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聚合酶"余同前&B&C反应条件为$DRE预变性

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5*3HI与限制性内切酶’%""于S;E温育GJ后"

同样经含溴乙锭的5K琼脂糖凝胶电泳分离后于

BL1CM1&N1荧光成像仪下观察结果"5;RGG0野

生等位基因有3个(%""酶切位点"消化后产生

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切位点消失#图5!&实验所需引物和试剂均从上海

生工生物工程技术服务有限公司处合成和购买&

!"#统计学分析方法

以#5检验比较性别’各基因型等分类变量在

结直肠癌病例组与对照组之间分布的差异"以成图5B&C/(%""酶切的b\&&305;+GG1]?B分型电泳图组)检验比较组间年龄的差异%采用#5拟合优度cFAdUX5b\&&305;+GG1T@T8VeX!HVB&\/\c:B_FYJ检验明确各变异基因型在对照组分布是否符合(%""!FAX%YF7@

LTU!V/WXF@HXUA#L/W!遗传平衡定律%采用非条件:T@X%3/+T@!G$00_F8!AX@7YVIX^7U05;+GG1%8T@X-$01:7AF%YFZ回归模型计算比值比#[\!及其D-K可信JXYXU7eVA7d%AX@7YVIX^7U05;+GG1%8T@XM$3**HI>?16TUaXUQ区间#&N!表示各基因型’联合基因型与结直肠癌

风险的关联性%以上统计分析均在]B]]3’Q*^7U

WF@!7_%中进行&同时采用‘L:F@aTAX]7^Y_TUX$结果

3Q5软件对结直肠癌病例组和对照组单体型分布$"!研究对象基本特征

进行预测&病例组与对照组相比"两组患者在年龄’性

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!""金明娟!等(4566%单核苷酸多态性与结直肠癌风险的关系

别!!"#等个体特征"以及吸烟!饮酒等常见环境锁不平衡现象"6II(6I3(63I和0II是最常见暴露因素的分布和$或构成比上差异均无显著性的/类单体型"上述/种单体型在病例组和对照组#表%$%表%中吸烟史定义为&每天吸烟%支以上"的分布频率总和分别为7-(-/8和7+(+/8"均大于且持续%年以上’"饮酒史则定义为&每天饮酒%7-8%然而"两组对象单体型分布差异也无显著性次以上"且持续&个月以上’%其中年龄(性别为本)!9)()-$%

研究的匹配因素"两组研究对象的性别构成基本

一致)!’%())$"年龄分布均衡)!’)(&*$"病例组的表"结直肠癌患者和对照人群等位基因和单体型分布中位年龄为+,岁"对照组为+-岁%&’()*"&/*30*:;*4.86-,10-(;1-2423>!>"%?#@&"

A"$@%%B"’46A"C!D"B’))*)*,’46/’5)2185*,-41/*

表!"#$例结直肠癌患者和%"!例正常5’1-*41,’461/*.24102),+.’,*,)9$,

对照人群的基本特征MFBV6D>FHDPR^@F=B>FR!Y@PWB

&’()*!+’,-../’0’.1*0-,1-.,231/*"#$.2)20*.1’).’4.*03PPBPBR@

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!"’#$%%&单核苷酸多态基因型分布与结直肠

!"!#$%%&单核苷酸多态等位基因及单体型分癌风险的相关性

布对照组携带*+&)/66(60和00基因型的频率

对.*+&)/0和1*2%-*3位点基因型检测分分别为/+(%)8(/*()-8和%%(2-8"携带*,/++II(型"分别有-例病例和-例对照样本未能成功扩I3和33基因型的频率分别为,+(/+8(**(/)8和增"对1*,/++3位点基因型检测分型"分别有*例%(%/8"携带*2%-*II(I3和33基因型的频率分病例和-例对照样本未能成功扩增%4566%单核别为-/(,%8(&+()/8和7(*-8*而病例组分别为苷酸多态等位基因及单体型分布见表*%结直肠癌-)(778(&2(%*8和%)(278",7()*8(%7(-%8和病例组携带*+&)/0(*,/++3和*2%-*3变异等位%(/+8"-&(7+8(&-(+/8和%)(/)8%基因型分布仅基因频率分别为*7(7-8(%%(**8和*2(**8"对照I*2%-3在对照组分布没有符合;JK遗传平衡定组分别为&*(2,8(%*(&/8和*,(*,8"各等位基因律"但在两组间均无显著性差异)!9)()-$%经年在两组间分布差异均无显著性)!9)()-$%病例组龄(性别(L"M(吸烟和饮酒状况等多因素校正"没和对照组4566%基因单体型分布频率和个体数有观察到45..%各多态基因型与结直肠癌风险存通过:;?@ABCDEFG@HB%(*软件进行预测"两组在显著相关关系)!9)()-$)表&$%以野生型联合对象等位基因分布经似然比!*检验均存在遗传连)..JIIJII$为对照组"分析各多态基因型联合与

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金明娟!等M)*++,单核苷酸多态性与结直肠癌风险的关系

!"#

结直肠癌易感性的相关关系!同样经以上因素校发生和促进其进展%)*++,基因编码蛋白本身没正!均没有观察到显著的相关关系"!!"#"$#"表%$%有催化活性!可通过与-(*-&(-.,&多聚核苷酸

激酶/磷酸酶&&’(连接酶!及&’(多聚酶"结

表!"#$$%各多态基因型的分布及与结直肠癌风险的合在&’(单链断裂修复和&’(碱基修复过程起

关系重要作用%)*++,基因0处最常见的单核苷酸多

&’()*!&+*,-*./*0123456-4(/64707,"8$$%$9:;9?=@@A!’03>9B%C9AD*0762E*5’036+*4-17--*)’64705的编码氨基酸发生变化((78,9%37:&(7816";

67-45F7,17)7-*16’)1’01*-)1’5*5"G$*(780994>?#!从而影响)*++,蛋白的功能活性!如4F?BPQ:FR+B?P7B>=-RP

+120"%3++16%"%2M,"$,"0"$"M99$,M"""*FGM$(780994>?变异可导致个体碱基切除修复能力降

+31$9"%1M"$$55"06M,1$,M0"""M50U1M01$"M06低!从而导致遗传学损伤水平增高!最终使机体对!!!!3350",,M6$$11","M69$,M""""M$5U,M55$,M""癌症的易感性发生变化)%!9*%

+3S33001"$0M9"$99"%9M",$"M55""M$$U,M"6$"M,0对1"5例结直肠癌病例和21,例正常对照415%22(44%5,"52M%2$,21"59M"1$,M"""*FGM$)*++,单核苷酸多态检测分型发现!结直肠癌病

4(,06"11M%"$%"",9M$,$"M95""M1%U0M9,$"M92

((5",M,%$0",M%2$"M5%""M,6U0M"5$"M26例组携带120"%3&15%22(和16,$1(变异等位基

4(S((,%$"10M$%$%0"1"M96$"M56""M$1U,M,6$"M1%因的频率分别为19#9$@&,,A11@和16#11@!对照416,$1(44005"$%M5,$,"9"$0M92$,M"""*FGM$组分别为01#65@&,1#0%@和15#15@!等位基因分

!!!!!4(111"02M"%$51"0$M2%$,M"6""M$9U,M92$"M6"布在两组间差异均无显著性"!!"#"$$%对照组即

(($5"9M1$$1,","M%"$,M"%""M$6U,M66$"M69正常人群各变异等位基因分布频率与现有对中国4(S((159"%$M19$90"%2M"%$"M9$""M26U,M0%$"M56汉族人群研究报道),"!,,*基本一致!与;B?8等),1*在R3EFVRPRBG)*++,+120"%3!415%22(!R?V416,$1(8F?BPQ:F=韩国人中开展的研究报道频率也基本一致%也进R7FW?RXRRT>F=R?V$!1!$:RP

7F=:FYPQMT(VZW=PFVTQR8F!=F[!TBVQ\R==

=\B^YBEB>]V7Q\B7:EM,"@$),0*%

有关)*++,基因单核苷酸多态与结直肠癌风

表="8$$%联合基因型的分布及与结直肠癌风险的关系险的相关性!现仅有少数文献报道!结果也不一

&’()*=&+*,-*./*0123456-4(/64707,"8$$%致%DEF7

-45F7,17)7-*16’)1’01*-%6例$首次报道了)*++,单)1’5*5(G$*核苷酸多态性与结直肠癌的相关性!研究认为

+B\T=-RP

(120"%]15%22]16,$1$R120"%3和16,$1(变异等位基因可增加早发性结

++]44]442$(,"M2%$19(,%M02$,M""(*FGM$直肠癌"C%"岁$的罹患风险%;B?8等),1*在韩国人++]44]4(S((,01(1,M2"$%6(10M52$"M61("M%5U,M%1$"M%6中开展的,H,病例对照研究"各1"9例$认为!++]4(S((]44%5(5M29$,2(5M91$"M5$("M05U,M$$$"M%%16,$1(变异等位基因与结直肠癌风险的增高显著++]4(S((]4(S((09(2M06$,"(%M9$$"M$6("M1$U,M01$"M,9

+3S33]44]44,51(16M,$$$,(1$M1$$"M2%("M05U,M,,$"M,,相关"I*+,#2,!9$J+K+,A"9L1M09$!对120"%3&

+3S33]44]4(S((,""(,2M05$01(,$M6%$"M50("M%"U,M01$"M1915%22(和16,$1(联合单体型的预测和分析认+3S33]4(S((]44%9(6M"1$,0(2M%%$"M$%("M1$U,M,5$"M,1为!单体型分布在病例组和对照组均存在遗传连+3S33]4(S((]4(S((5(,M,$$0(,M%9$"M5%("M,%U0M9,$"M51锁不平衡现象!仅存在+44&+4(&+(4和344%R3EFVRPRBG,"YB?P7B>=R?V$:RPRT>FM类单体型!并且单体型分布在病例和对照组间存T(VZW=PFVTQR8F!=F[!TBVQ\R==

R?VR>YBEB>]V7

关关系"I*+,M$9!9$O+K+,#",L1#$9$%本研究采

外环境化学致癌物和离子辐射等物理因素作用,H0配对的病例对照研究方法!在浙江省嘉善县用于机体导致的&’(碱基损伤和&’(链断裂!,969年建立的结直肠癌自然人群随访队列中开展是组织细胞癌变的重要分子事件!可诱发癌症的了)*++,基因单核苷酸多态与结直肠癌风险的

CMYK

!"#金明娟!等0GH@@_单核苷酸多态性与结直肠癌风险的关系

相关性研究!对!"#$%&"’(%"")和*+,-*)#处单R=?75V9V&J’0EQ=7=H9R#’///#%-B$,%(,K,+0核苷酸多态基因定型分析发现#单个变异基因型&%’:O95EH#J;59RFE#E;O?95>94R9?20Z;5P;5R9?T7=4T9与结直肠癌风险不存在显著相关关系$!./0/-%!7U45;7P4VRQWR=4=Q=4;5T7?475=R9^4R=7=\;MYU;?\O4P对变异基因型的联合分析同样也没有观察到显著

@75P9?H9R#_BB+#-+$%%("$%K"$+0

相关关系$!./0/-%!同时#研究通过单体型分析软&-’@O95‘#@74J#34QGa#9=7M0Z9R=9VP7R9bP;5=?;MR=QVY;5件123456789:;7?9,0!对两组对象的单体型=O9?4R6

P75P9?75V?9P=7MP75P9?&J’0@75P9?L9=9PN?9T#!$$-#!B

型#其在两组对象内的分布频率总和均大于B-C#$!%(_%"K_-%0与2;58等&,!’研究结果基本一致!然而单体型分布&(’:O9?47?945VQP9V45OQU75MYU\O;PY=9RWY=O9=;W7PP;bR\9P4

&+’DQ=649>4PeL#HQR45E#159>;MV3#9=7M0A959=4P

上进行了估计#没有对每个个体单体型的真实分\;MYU;?\O4RUR45LZ)?9\74?8959R75V?4R6;

综上所述#在浙江省嘉善县开展的以自然人&_$’宋春英#谭文#林东昕0中国人LZ)修复基因GH@@_

单核苷酸多态及其与食管癌风险的关系&J’0癌症#!$$_#

群为基础的病例对照研究表明#GH@@,@’"#/%&"!$$_%(!+K[_0A’(%"")和A’+,-’)单核苷酸多态与结直肠癌的&__’H7=57R458O9L#a7;:G#&758?97J)#9=7M0N;MYU;?\O4RUR发病风险没有相关关系!对单体型的分析发现#;

GH@@_8959#7MP;O;MP;5RQU\=4;575VP;M;?9P=7MP75P9?&J’0

最常见的%类单体型!F5=J@75P9?#!$$-#__"$[%(%!+K%[!0

&_[’:=9?5E@#XUW7POLE#A4MR@2#9=7M0LZ)?9\74?8959

!参考文献"GH@@_\;MYU;?\O4RUR#RU;6458#75VWM7VV9?P75P9??4R6

&_’中华人民共和国卫生部0中国癌症预防与控制规划纲要&J’0@75P9?1\4V9U4;MD4;U7?69?RN?9T#!$$_#_$$!%(_!-K

’//%I!/,/&J’0中国肿瘤#*//%#,#$,%("-K"+0_[_0&!’L;MMH#N9=;H0&O9P7QR9R;

;75&J’0@75P9?39==#!$$-#!!%$!%(!(BK!++0&[’&O;U\R;532#]9R=EA0GH@@,699\RLZ)


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