教您正确选择逆转录酶,适用6种不同应用

逆转录反应,作为分子生物学研究的基本技术之一,已经广泛应用到多个研究领域,可以说是科研人员进行RNA功能研究的看家本事。

众所周知,逆转录的应用领域有以下6种:

逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)

定量RT-PCR(RT-qPCR)

cDNA克隆和文库构建

cDNA末端快速扩增(RACE)

基因表达芯片

RNA测序(RNA-Seq)

今天,小编就整理了一些贴士,帮助大家在面对6种不同的应用时,如何正确选择逆转录酶。

逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)

在RT-PCR中,逆转录酶将RNA转化为cDNA,然后通过PCR反应扩增cDNA,为下游实验提供研究模板,因而逆转录酶是实验成功的关键步骤之一(如下图)。选定的逆转录酶应对所有样本均具有最高效率,即便是难转录RNA样本,如降解、抑制剂残留或具有高度二级结构的RNA样本。

图. 逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)。RT =逆转录,RTase =逆转录酶

常用的RT-PCR方法分为一步法和两步法,每种方法都各有优缺点,简要概述如下:

表. 对比一步法和两步法RT-PCR

想要直观、生动的了解这两种方法的不同,可以点击“阅读原文”观看如下视频

定量RT-PCR(RT-qPCR)

定量RT-PCR(RT-qPCR)的最常见应用之一是通过对细胞和组织一段时间或事件后(如,药物治疗)实时mRNA水平的定量分析。RT-qPCR比RT-PCR的灵敏度更高, RT-qPCR基因表达定量的准确性在很大程度上取决于cDNA模板的质量和数量。因此,逆转录对于RT-qPCR的成功至关重要。所选择的逆转录酶应该具有以下特点:

高效合成cDNA的能力,即使是对低丰度基因以及次优质和/或难转录RNA样本。

在宽的RNA起始量范围内,cDNA的动态范围或线性度最佳,可确保基因表达定量的准确性。

所选试剂在扩增过程中应产生较高且一致的cDNA得率,以获得具有高灵敏度和低变异性的基因表达结果。可考虑预混液形式的逆转录酶用以可以减少实验误差。

RT-qPCR的一个特殊程序是从未经RNA分离的粗细胞裂解物直接进行逆转录。在使用稀缺样本或选用群体内特定细胞的实验,可考虑使用直接RT-qPCR法来防止可能的样本损失和低RNA回收。

逆转录反应,作为分子生物学研究的基本技术之一,已经广泛应用到多个研究领域,可以说是科研人员进行RNA功能研究的看家本事。

众所周知,逆转录的应用领域有以下6种:

逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)

定量RT-PCR(RT-qPCR)

cDNA克隆和文库构建

cDNA末端快速扩增(RACE)

基因表达芯片

RNA测序(RNA-Seq)

今天,小编就整理了一些贴士,帮助大家在面对6种不同的应用时,如何正确选择逆转录酶。

逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)

在RT-PCR中,逆转录酶将RNA转化为cDNA,然后通过PCR反应扩增cDNA,为下游实验提供研究模板,因而逆转录酶是实验成功的关键步骤之一(如下图)。选定的逆转录酶应对所有样本均具有最高效率,即便是难转录RNA样本,如降解、抑制剂残留或具有高度二级结构的RNA样本。

图. 逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)。RT =逆转录,RTase =逆转录酶

常用的RT-PCR方法分为一步法和两步法,每种方法都各有优缺点,简要概述如下:

表. 对比一步法和两步法RT-PCR

想要直观、生动的了解这两种方法的不同,可以点击“阅读原文”观看如下视频

定量RT-PCR(RT-qPCR)

定量RT-PCR(RT-qPCR)的最常见应用之一是通过对细胞和组织一段时间或事件后(如,药物治疗)实时mRNA水平的定量分析。RT-qPCR比RT-PCR的灵敏度更高, RT-qPCR基因表达定量的准确性在很大程度上取决于cDNA模板的质量和数量。因此,逆转录对于RT-qPCR的成功至关重要。所选择的逆转录酶应该具有以下特点:

高效合成cDNA的能力,即使是对低丰度基因以及次优质和/或难转录RNA样本。

在宽的RNA起始量范围内,cDNA的动态范围或线性度最佳,可确保基因表达定量的准确性。

所选试剂在扩增过程中应产生较高且一致的cDNA得率,以获得具有高灵敏度和低变异性的基因表达结果。可考虑预混液形式的逆转录酶用以可以减少实验误差。

RT-qPCR的一个特殊程序是从未经RNA分离的粗细胞裂解物直接进行逆转录。在使用稀缺样本或选用群体内特定细胞的实验,可考虑使用直接RT-qPCR法来防止可能的样本损失和低RNA回收。


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